Вопросы с тегом «mixed-model»

Я анализирую некоторые поведенческие данные, используя lme4in R, в основном следуя отличным учебникам Бодо Винтера , но не понимаю, правильно ли я обрабатываю взаимодействия. Хуже того, никто другой, участвующий в этом исследовании, не использует смешанные модели, поэтому я немного волнуюсь, чтобы убедиться, что все правильно. Вместо того, чтобы просто плакать …

10 r  mixed-model  p-value  lme4-nlme 

Какова структура дисперсии-ковариации по умолчанию для случайных эффектов в glmerили lmerв lme4пакете? Как определить другую дисперсионно-ковариационную структуру для случайных эффектов в коде? Я не мог найти информацию об этом в lme4документации.

10 mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

Этот вопрос / тема возникла в дискуссии с коллегой, и я искал несколько мнений по этому поводу: Я моделирую некоторые данные, используя логистическую регрессию со случайными эффектами, точнее - логистическую регрессию со случайным перехватом. Для фиксированных эффектов у меня есть 9 переменных, которые представляют интерес и учитываются. Я хотел бы …

10 mixed-model  model-selection  aic  glmm  stepwise-regression 

Это всего лишь пример, с которым я сталкивался несколько раз, поэтому у меня нет примеров данных. Запуск модели линейной регрессии в R: a.lm = lm(Y ~ x1 + x2) x1является непрерывной переменной x2является категориальным и имеет три значения, например, «Низкий», «Средний» и «Высокий». Однако вывод, заданный R, будет выглядеть примерно …

10 r  regression  categorical-data  regression-coefficients  categorical-encoding  machine-learning  random-forest  anova  spss  r  self-study  bootstrap  monte-carlo  r  multiple-regression  partitioning  neural-networks  normalization  machine-learning  svm  kernel-trick  self-study  survival  cox-model  repeated-measures  survey  likert  correlation  variance  sampling  meta-analysis  anova  independence  sample  assumptions  bayesian  covariance  r  regression  time-series  mathematical-statistics  graphical-model  machine-learning  linear-model  kernel-trick  linear-algebra  self-study  moments  function  correlation  spss  probability  confidence-interval  sampling  mean  population  r  generalized-linear-model  prediction  offset  data-visualization  clustering  sas  cart  binning  sas  logistic  causality  regression  self-study  standard-error  r  distributions  r  regression  time-series  multiple-regression  python  chi-squared  independence  sample  clustering  data-mining  rapidminer  probability  stochastic-processes  clustering  binary-data  dimensionality-reduction  svd  correspondence-analysis  data-visualization  excel  c#  hypothesis-testing  econometrics  survey  rating  composite  regression  least-squares  mcmc  markov-process  kullback-leibler  convergence  predictive-models  r  regression  anova  confidence-interval  survival  cox-model  hazard  normal-distribution  autoregressive  mixed-model  r  mixed-model  sas  hypothesis-testing  mediation  interaction 

Я пытаюсь иметь дело с анализом времени на событие, используя повторяющиеся двоичные результаты. Предположим, что время до события измеряется днями, но на данный момент мы делим время на недели. Я хочу приблизить оценку Каплана-Мейера (но учесть ковариаты), используя повторяющиеся двоичные результаты. Это может показаться окольным путем, но я исследую, как …

9 mixed-model  survival  random-effects-model  recurrent-events 

Нередко случается, когда имеет дело со сложными максимальными смешанными моделями (оценка всех возможных случайных эффектов для данных и модели), это идеальная (+1 или -1) или почти идеальная корреляция между некоторыми случайными эффектами. В целях обсуждения давайте рассмотрим следующую модель и краткое изложение модели Model: Y ~ X*Cond + (X*Cond|subj) # …

9 r  correlation  mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

Примеры: у меня есть предложение в должностной инструкции: «Старший инженер Java в Великобритании». Я хочу использовать модель глубокого обучения, чтобы предсказать ее как 2 категории: English и IT jobs. Если я использую традиционную классификационную модель, она может предсказать только 1 метку с softmaxфункцией на последнем слое. Таким образом, я могу …

9 machine-learning  deep-learning  natural-language  tensorflow  sampling  distance  non-independent  application  regression  machine-learning  logistic  mixed-model  control-group  crossover  r  multivariate-analysis  ecology  procrustes-analysis  vegan  regression  hypothesis-testing  interpretation  chi-squared  bootstrap  r  bioinformatics  bayesian  exponential  beta-distribution  bernoulli-distribution  conjugate-prior  distributions  bayesian  prior  beta-distribution  covariance  naive-bayes  smoothing  laplace-smoothing  distributions  data-visualization  regression  probit  penalized  estimation  unbiased-estimator  fisher-information  unbalanced-classes  bayesian  model-selection  aic  multiple-regression  cross-validation  regression-coefficients  nonlinear-regression  standardization  naive-bayes  trend  machine-learning  clustering  unsupervised-learning  wilcoxon-mann-whitney  z-score  econometrics  generalized-moments  method-of-moments  machine-learning  conv-neural-network  image-processing  ocr  machine-learning  neural-networks  conv-neural-network  tensorflow  r  logistic  scoring-rules  probability  self-study  pdf  cdf  classification  svm  resampling  forecasting  rms  volatility-forecasting  diebold-mariano  neural-networks  prediction-interval  uncertainty 

В продольном исследовании результаты YitYяTY_{it} единиц iяi многократно измеряются в моменты времени tTt с общим числом фиксированных измерений mмm (фиксированные = измерения в единицах измерения проводятся одновременно). Единицы случайным образом назначаются либо на лечение, G=1гзнак равно1G=1 , либо на контрольную группу, G=0гзнак равно0G=0 . Я хочу оценить и проверить средний …

9 mixed-model  panel-data  multilevel-analysis  random-effects-model  fixed-effects-model 

На странице 12 книги Бейтса о модели смешанного эффекта он описывает модель следующим образом: В конце скриншота он упоминает коэффициент относительной ковариации , зависящий от параметра дисперсионной составляющей , θΛθΛθ\Lambda_{\theta}θθ\theta не объясняя, что именно отношения. Скажем , нам дается , как бы мы выводим Л θ от него?θθ\thetaΛθΛθ\Lambda_{\theta} С другой …

9 mixed-model  references  multilevel-analysis 

Я подгоняю glmerмодель в lme4пакете R. Я ищу таблицу anova с показанным в ней значением p, но я не могу найти пакет, который подходит ей. Возможно ли сделать это в R? Модель, которая мне подходит, имеет форму: model1<-glmer(dmn~period*teethTreated+(1|fullName), family="poisson", data=subset(dataset, group=='Four times a year'), control=glmerControl(optimizer="bobyqa"))

9 r  anova  lme4-nlme  mixed-model 

У меня есть такие модели: require(nlme) set.seed(123) n <- 100 k <- 5 cat <- as.factor(rep(1:k, n)) cat_i <- 1:k # intercept per kategorie x <- rep(1:n, each = k) sigma <- 0.2 alpha <- 0.001 y <- cat_i[cat] + alpha * x + rnorm(n*k, 0, sigma) plot(x, y) m1 …

9 r  mixed-model  aic 

Я пытаюсь проанализировать влияние года на переменную logInd для конкретной группы лиц (у меня есть 3 группы). Самая простая модель: > fix1 = lm(logInd ~ 0 + Group + Year:Group, data = mydata) > summary(fix1) Call: lm(formula = logInd ~ 0 + Group + Year:Group, data = mydata) Residuals: Min …

9 r  mixed-model  lme4-nlme  random-effects-model 

Следующие прививки взяты из этой статьи . Я новичок в начальной загрузке и пытаюсь реализовать параметрическую, полупараметрическую и непараметрическую загрузку начальной загрузки для линейной смешанной модели с R bootпакетом. Код R Вот мой Rкод: library(SASmixed) library(lme4) library(boot) fm1Cult <- lmer(drywt ~ Inoc + Cult + (1|Block) + (1|Cult), data=Cultivation) fixef(fm1Cult) …

9 r  mixed-model  bootstrap  central-limit-theorem  stable-distribution  time-series  hypothesis-testing  markov-process  r  correlation  categorical-data  association-measure  meta-analysis  r  anova  confidence-interval  lm  r  bayesian  multilevel-analysis  logit  regression  logistic  least-squares  eda  regression  notation  distributions  random-variable  expected-value  distributions  markov-process  hidden-markov-model  r  variance  group-differences  microarray  r  descriptive-statistics  machine-learning  references  r  regression  r  categorical-data  random-forest  data-transformation  data-visualization  interactive-visualization  binomial  beta-distribution  time-series  forecasting  logistic  arima  beta-regression  r  time-series  seasonality  large-data  unevenly-spaced-time-series  correlation  statistical-significance  normalization  population  group-differences  demography 

В настоящее время я работаю над серией моделей временных рядов Пуассона, пытаясь оценить влияние изменения в том, как были получены подсчеты (переключение с одного диагностического теста на другой), в то же время контролируя другие тренды во времени (скажем, общее увеличение заболеваемость). У меня есть данные для разных сайтов. Хотя я …

9 mixed-model  generalized-linear-model  poisson-distribution  random-effects-model 

У меня достаточно сложный набор данных для анализа, и я не могу найти для него хорошего решения. Вот эта вещь: 1. сырые данные по существу записи песен насекомых. Каждая песня состоит из нескольких очередей, а каждая - из подразделений. Все лица были зарегистрированы в течение 5 минут. Количество пакетов и …

9 time-series  mixed-model  repeated-measures  random-effects-model