Вопросы с тегом «contingency-tables»

mgcvПакет Rимеет две функции для установки взаимодействия Тензор продукта: te()и ti(). Я понимаю основное разделение труда между ними (подгонка нелинейного взаимодействия против разложения этого взаимодействия на основные эффекты и взаимодействие). Чего я не понимаю, так это почему te(x1, x2)и ti(x1) + ti(x2) + ti(x1, x2)может дать (немного) разные результаты. MWE …

11 r  gam  mgcv  conditional-probability  mixed-model  references  bayesian  estimation  conditional-probability  machine-learning  optimization  gradient-descent  r  hypothesis-testing  wilcoxon-mann-whitney  time-series  bayesian  inference  change-point  time-series  anova  repeated-measures  statistical-significance  bayesian  contingency-tables  regression  prediction  quantiles  classification  auc  k-means  scikit-learn  regression  spatial  circular-statistics  t-test  effect-size  cohens-d  r  cross-validation  feature-selection  caret  machine-learning  modeling  python  optimization  frequentist  correlation  sample-size  normalization  group-differences  heteroscedasticity  independence  generalized-least-squares  lme4-nlme  references  mcmc  metropolis-hastings  optimization  r  logistic  feature-selection  separation  clustering  k-means  normal-distribution  gaussian-mixture  kullback-leibler  java  spark-mllib  data-visualization  categorical-data  barplot  hypothesis-testing  statistical-significance  chi-squared  type-i-and-ii-errors  pca  scikit-learn  conditional-expectation  statistical-significance  meta-analysis  intuition  r  time-series  multivariate-analysis  garch  machine-learning  classification  data-mining  missing-data  cart  regression  cross-validation  matrix-decomposition  categorical-data  repeated-measures  chi-squared  assumptions  contingency-tables  prediction  binary-data  trend  test-for-trend  matrix-inverse  anova  categorical-data  regression-coefficients  standard-error  r  distributions  exponential  interarrival-time  copula  log-likelihood  time-series  forecasting  prediction-interval  mean  standard-error  meta-analysis  meta-regression  network-meta-analysis  systematic-review  normal-distribution  multiple-regression  generalized-linear-model  poisson-distribution  poisson-regression  r  sas  cohens-kappa 

В своей работе я видел несколько применений точного теста Фишера, и мне было интересно, насколько хорошо он соответствует моим данным. Просматривая несколько источников, я понял, как рассчитать статистику, но так и не увидел четкого и формального объяснения предполагаемой нулевой гипотезы. Может кто-нибудь объяснить или направить меня к формальному объяснению предполагаемого …

11 hypothesis-testing  chi-squared  multinomial  contingency-tables  fishers-exact 

Я анализирую таблицу 2х2 из небольшого набора данных из 30 пациентов. Мы ретроспективно пытаемся найти некоторые переменные, которые дают подсказку о том, какое лечение выбрать. Переменные (общепринятые / странные) и решение о лечении (A / B) представляют особый интерес, и поэтому данные выглядят так: Obs/Tr. Dec.normalstrangeA12012B1351825530Obs/Tr. Dec.ABnormal121325strange055121830\begin{array} {|r|r|r|r|} \hline \text{Obs/Tr. …

11 chi-squared  power  contingency-tables  fishers-exact 

Предположим, у нас есть следующий набор данных: Men Women Dieting 10 30 Non-dieting 5 60 Если я запускаю точный тест Фишера в R, то что alternative = greater(или меньше) подразумевается? Например: mat = matrix(c(10,5,30,60), 2,2) fisher.test(mat, alternative="greater") Я получаю p-value = 0.01588и odds ratio = 3.943534. Кроме того, когда я …

11 r  statistical-significance  contingency-tables  fishers-exact 

Ниже приводится вопрос о множестве визуализаций, предлагаемых в качестве «доказательства по картинке» о существовании парадокса Симпсона, и, возможно, вопрос о терминологии. Парадокс Симпсона - довольно простое явление, которое можно описать и привести числовые примеры (причина, по которой это может произойти, глубока и интересна). Парадокс заключается в том, что существуют таблицы …

10 mathematical-statistics  data-visualization  causality  contingency-tables  simpsons-paradox 

Я пытаюсь понять использование логистической регрессии в таблицах сопряженности 2x2 и Ix2. Например, используя это в качестве примера В чем разница между использованием критерия хи-квадрат и логистической регрессией? Как насчет таблицы с несколькими номинальными коэффициентами (таблица Ix2), например: Существует аналогичный вопрос здесь - но ответ в основном , что хи-квадрат …

10 logistic  chi-squared  logit  contingency-tables 

Я проверяю независимость в таблице непредвиденных обстоятельствЯ не знаю, лучше ли G-тест или критерий хи-квадрат Пирсона. Размер выборки исчисляется сотнями, но есть небольшое количество клеток. Как указано на странице Википедии , приближение к распределению хи-квадрат лучше для G-теста, чем для теста Пирсона. Но я использую симуляцию Монте-Карло для вычисления значения …

10 chi-squared  p-value  monte-carlo  contingency-tables 

Я проверяю независимость двух переменных, A и B, стратифицированных по C. A и B являются двоичными переменными, а C является категориальным (5 значений). Выполняя точный тест Фишера для A и B (все слои объединены), я получаю: ## (B) ## (A) FALSE TRUE ## FALSE 1841 85 ## TRUE 915 74 …

10 categorical-data  interpretation  inference  contingency-tables  fishers-exact 

У меня есть GLMM формы: lmer(present? ~ factor1 + factor2 + continuous + factor1*continuous + (1 | factor3), family=binomial) Когда я использую drop1(model, test="Chi"), я получаю другие результаты, чем если бы я использовал Anova(model, type="III")из пакета автомобиля или summary(model). Последние два дают одинаковые ответы. Используя кучу сфабрикованных данных, я обнаружил, …

10 r  anova  glmm  r  mixed-model  bootstrap  sample-size  cross-validation  roc  auc  sampling  stratification  random-allocation  logistic  stata  interpretation  proportion  r  regression  multiple-regression  linear-model  lm  r  cross-validation  cart  rpart  logistic  generalized-linear-model  econometrics  experiment-design  causality  instrumental-variables  random-allocation  predictive-models  data-mining  estimation  contingency-tables  epidemiology  standard-deviation  mean  ancova  psychology  statistical-significance  cross-validation  synthetic-data  poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis  distributions  binomial  classification  k-means  distance  unsupervised-learning  euclidean  correlation  chi-squared  spearman-rho  forecasting  excel  exponential-smoothing  binomial  sample-size  r  change-point  wilcoxon-signed-rank  ranks  clustering  matlab  covariance  covariance-matrix  normal-distribution  simulation  random-generation  bivariate  standardization  confounding  z-statistic  forecasting  arima  minitab  poisson-distribution  negative-binomial  poisson-regression  overdispersion  probability  self-study  markov-process  estimation  maximum-likelihood  classification  pca  group-differences  chi-squared  survival  missing-data  contingency-tables  anova  proportion 

Я сравниваю две группы мутантов, каждая из которых может иметь только один из 21 различных фенотипов. Я хотел бы посмотреть, одинаково ли распределение этих результатов между двумя группами. Я нашел онлайн-тест, который вычисляет «критерий хи-квадрат для равенства распределений» и дает мне некоторые правдоподобные результаты. Тем не менее, в этой таблице …

10 distributions  chi-squared  contingency-tables 

Приведено случаев с раком легких и подобранных контролей (без рака легких) (сопоставление по возрасту, полу и т. Д.). Чтобы попытаться найти доказательства между влиянием курения на рак легких, я использовал точный критерий Фишера в таблице непредвиденных обстоятельств. Это, однако, не принимало во внимание, что контроль и случаи были сопоставлены. 40404040404040 …

9 contingency-tables  fishers-exact  paired-data  mcnemar-test 

Я работаю с примерами из анализа Крушке « Байесовский анализ данных» , в частности, с использованием экспоненциального ANOVA Пуассона в гл. 22, который он представляет в качестве альтернативы частым тестам хи-квадрат независимости для таблиц непредвиденных обстоятельств. Я вижу, как мы получаем информацию о взаимодействиях, которые происходят более или менее часто, …

9 r  bayesian  effect-size  contingency-tables 

У меня есть набор данных с двумя категориальными номинальными переменными (обе с 5 категориями). Я хотел бы знать, если (и как) я могу определить потенциальные корреляции между категориями из этих двух переменных. Другими словами, показывают ли, например, результаты категории в переменной 1 сильную корреляцию с определенной категорией j в переменной …

9 correlation  residuals  contingency-tables  categorical-data