Вопросы с тегом «negative-binomial»

После выполнения анализа главных компонентов (PCA) я хочу спроецировать новый вектор на пространство PCA (т.е. найти его координаты в системе координат PCA). Я рассчитал PCA на языке R, используя prcomp. Теперь я должен быть в состоянии умножить свой вектор на матрицу вращения PCA. Должны ли главные компоненты в этой матрице …

21 r  pca  r  variance  heteroscedasticity  misspecification  distributions  time-series  data-visualization  modeling  histogram  kolmogorov-smirnov  negative-binomial  likelihood-ratio  econometrics  panel-data  categorical-data  scales  survey  distributions  pdf  histogram  correlation  algorithms  r  gpu  parallel-computing  approximation  mean  median  references  sample-size  normality-assumption  central-limit-theorem  rule-of-thumb  confidence-interval  estimation  mixed-model  psychometrics  random-effects-model  hypothesis-testing  sample-size  dataset  large-data  regression  standard-deviation  variance  approximation  hypothesis-testing  variance  central-limit-theorem  kernel-trick  kernel-smoothing  error  sampling  hypothesis-testing  normality-assumption  philosophical  confidence-interval  modeling  model-selection  experiment-design  hypothesis-testing  statistical-significance  power  asymptotics  information-retrieval  anova  multiple-comparisons  ancova  classification  clustering  factor-analysis  psychometrics  r  sampling  expectation-maximization  markov-process  r  data-visualization  correlation  regression  statistical-significance  degrees-of-freedom  experiment-design  r  regression  curve-fitting  change-point  loess  machine-learning  classification  self-study  monte-carlo  markov-process  references  mathematical-statistics  data-visualization  python  cart  boosting  regression  classification  robust  cart  survey  binomial  psychometrics  likert  psychology  asymptotics  multinomial 

Точность определяется как: p = true positives / (true positives + false positives) Является ли это исправить , что, как true positivesи false positivesподход 0, точность приближается к 1? Тот же вопрос для отзыва: r = true positives / (true positives + false negatives) В настоящее время я выполняю статистический …

20 precision-recall  data-visualization  logarithm  references  r  networks  data-visualization  standard-deviation  probability  binomial  negative-binomial  r  categorical-data  aggregation  plyr  survival  python  regression  r  t-test  bayesian  logistic  data-transformation  confidence-interval  t-test  interpretation  distributions  data-visualization  pca  genetics  r  finance  maximum  probability  standard-deviation  probability  r  information-theory  references  computational-statistics  computing  references  engineering-statistics  t-test  hypothesis-testing  independence  definition  r  censoring  negative-binomial  poisson-distribution  variance  mixed-model  correlation  intraclass-correlation  aggregation  interpretation  effect-size  hypothesis-testing  goodness-of-fit  normality-assumption  small-sample  distributions  regression  normality-assumption  t-test  anova  confidence-interval  z-statistic  finance  hypothesis-testing  mean  model-selection  information-geometry  bayesian  frequentist  terminology  type-i-and-ii-errors  cross-validation  smoothing  splines  data-transformation  normality-assumption  variance-stabilizing  r  spss  stata  python  correlation  logistic  logit  link-function  regression  predictor  pca  factor-analysis  r  bayesian  maximum-likelihood  mcmc  conditional-probability  statistical-significance  chi-squared  proportion  estimation  error  shrinkage  application  steins-phenomenon 

Некоторые из вас, возможно, читали эту прекрасную статью: O'Hara RB, Kotze DJ (2010) Не регистрируйте данные преобразований. Методы в экологии и эволюции 1: 118–122. Клик . В моей области исследований (экотоксикология) мы имеем дело с плохо реплицированными экспериментами, и GLM не используются широко. Поэтому я выполнил моделирование, аналогичное O'Hara & …

18 r  generalized-linear-model  simulation  negative-binomial  type-i-and-ii-errors 

Skellam Распределение описывает разницу между двумя переменными , которые имеют распределение Пуассона. Существует ли подобное распределение, которое описывает разницу между переменными, которые следуют отрицательным биномиальным распределениям? Мои данные получены с помощью процесса Пуассона, но содержат значительное количество шума, что приводит к чрезмерному рассредоточению в распределении. Таким образом, моделирование данных с …

18 distributions  modeling  poisson-distribution  negative-binomial  skellam 

Мы с тобой решили сыграть в игру, в которой мы по очереди подбрасываем монету. Первый игрок, который перевернет 10 голов, выигрывает игру. Естественно, есть спор о том, кто должен идти первым. Моделирование этой игры показывает, что игрок, который переворачивает первый, выигрывает на 6% больше, чем игрок, который переворачивает второй (первый …

17 probability  python  binomial  negative-binomial 

Вопрос Дисперсия отрицательного биномиального (NB) распределения всегда больше его среднего значения. Когда среднее значение выборки превышает ее дисперсию, попытка подобрать параметры NB с максимальной вероятностью или с оценкой момента не удастся (решения с конечными параметрами не существует). Однако возможно, что выборка, взятая из распределения NB, имеет среднее значение, превышающее дисперсию. …

17 estimation  maximum-likelihood  negative-binomial 

У меня есть следующая гистограмма данных подсчета. И я хотел бы приспособить к этому дискретное распределение. Я не уверен, как я должен идти об этом. Должен ли я сначала наложить на гистограмму дискретное распределение, скажем, отрицательное биномиальное распределение, чтобы получить параметры дискретного распределения, а затем выполнить тест Колмогорова – Смирнова …

17 r  poisson-distribution  discrete-data  computational-statistics  negative-binomial 

Существует ли такой пакет, который обеспечивает нулевую раздувание отрицательной биномиальной оценки модели смешанных эффектов в R? Под этим я подразумеваю: Нулевая инфляция, где вы можете указать биномиальную модель для нулевой инфляции, как в функции zeroinfl в пакете pscl: zeroinfl (y ~ X | Z, dist = "negbin") где Z - …

17 r  mixed-model  count-data  negative-binomial  zero-inflation 

Отрицательное биномиальное распределение стало популярной моделью для подсчета данных (в частности, ожидаемое количество считываний секвенирования в пределах данной области генома из данного эксперимента) в биоинформатике. Объяснения различаются: Некоторые объясняют это как то, что работает как распределение Пуассона, но имеет дополнительный параметр, предоставляющий больше свободы для моделирования истинного распределения с дисперсией, …

16 poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis 

Распределение Пуассона может измерять события в единицу времени, а параметр равен λλ\lambda . Экспоненциальное распределение измеряет время до следующего события с параметром 1λ1λ\frac{1}{\lambda} . Можно преобразовать одно распределение в другое, в зависимости от того, проще ли моделировать события или время. Теперь гамма-пуассон - это «растянутый» пуассон с большей дисперсией. Распределение …

16 poisson-distribution  negative-binomial  gamma-distribution  exponential-family 

Какова подходящая стратегия для решения, какую модель использовать с данными подсчета? У меня есть данные подсчета, которые мне нужно моделировать как многоуровневые модели, и мне (на этом сайте) было рекомендовано, что лучший способ сделать это - через ошибки или MCMCglmm. Однако я все еще пытаюсь узнать о байесовской статистике, и …

16 poisson-distribution  generalized-linear-model  negative-binomial  overdispersion 

Я часто видел советы по проверке того, является ли подход Пуассона более рассредоточенным, включая деление остаточного отклонения на степени свободы. Результирующее соотношение должно быть «примерно 1». Вопрос в том, о каком диапазоне мы говорим о «приблизительном» - каково соотношение, которое должно вызывать сигналы тревоги для рассмотрения альтернативных форм моделей?

16 poisson-distribution  negative-binomial  poisson-regression  overdispersion 

Какое ожидаемое количество раз вы должны бросить кубик, пока каждая сторона не появится 3 раза? Этот вопрос был задан в начальной школе в Новой Зеландии, и он был решен с помощью моделирования. Каково аналитическое решение этой проблемы?

15 probability  multinomial  negative-binomial  coupon-collector-problem 

Итак, я хочу подобрать случайную модель негативных биномиальных эффектов. Для такой модели STATA может производить экспоненциальные коэффициенты. Согласно справочному файлу такие коэффициенты можно интерпретировать как коэффициенты заболеваемости. К сожалению, я не являюсь носителем английского языка, и я не очень понимаю, что такое коэффициенты заболеваемости или как я могу их перевести. …

14 interpretation  negative-binomial  regression-coefficients 

Я только что запустил отрицательный биномиальный GLM, и это вывод: Call: glm.nb(formula = small ~ method + site + depth, data = size.dat, init.theta = 1.080668549, link = log) Deviance Residuals: Min 1Q Median 3Q Max -2.2452 -0.9973 -0.3028 0.3864 1.8727 Coefficients: Estimate Std. Error z value Pr(>|z|) (Intercept) 1.6954 …

14 r  categorical-data  generalized-linear-model  interpretation  negative-binomial