Вопросы с тегом «anova»

Недавно я понял, что смешанная модель с единственным субъектом в качестве случайного фактора и другими факторами в качестве фиксированных факторов эквивалентна ANOVA при настройке корреляционной структуры смешанной модели на составную симметрию. Поэтому я хотел бы знать, что означает составная симметрия в контексте смешанного (т. Е. Расщепленного) ANOVA, в лучшем случае …

35 correlation  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Дорогие, я заметил нечто странное, что не могу объяснить, не так ли? В итоге: ручной подход к вычислению доверительного интервала в модели логистической регрессии и функция R confint()дают разные результаты. Я проходил Прикладную логистическую регрессию Хосмера и Лемешоу (2-е издание). В 3-й главе приведен пример расчета отношения шансов и 95% …

34 r  regression  logistic  confidence-interval  profile-likelihood  correlation  mcmc  error  mixture  measurement  data-augmentation  r  logistic  goodness-of-fit  r  time-series  exponential  descriptive-statistics  average  expected-value  data-visualization  anova  teaching  hypothesis-testing  multivariate-analysis  r  r  mixed-model  clustering  categorical-data  unsupervised-learning  r  logistic  anova  binomial  estimation  variance  expected-value  r  r  anova  mixed-model  multiple-comparisons  repeated-measures  project-management  r  poisson-distribution  control-chart  project-management  regression  residuals  r  distributions  data-visualization  r  unbiased-estimator  kurtosis  expected-value  regression  spss  meta-analysis  r  censoring  regression  classification  data-mining  mixture 

Из документации для anova(): Когда задана последовательность объектов, anova проверяет модели друг против друга в указанном порядке ... Что значит проверять модели друг против друга? И почему порядок имеет значение? Вот пример из учебника GenABEL : > modelAdd = lm(qt~as.numeric(snp1)) > modelDom = lm(qt~I(as.numeric(snp1)>=2)) > modelRec = lm(qt~I(as.numeric(snp1)>=3)) anova(modelAdd, modelGen, …

32 r  anova 

Я анализирую экспериментальные данные. Данные состоят из парного вектора типа лечения и биномиального исхода: Treatment Outcome A 1 B 0 C 0 D 1 A 0 ... В столбце результатов 1 означает успех, а 0 - сбой. Я хотел бы выяснить, значительно ли меняет результат лечение. Есть 4 различных лечения …

32 logistic  anova  binomial  experiment-design 

Скажем, например, вы делаете линейную модель, но данные сложны.yyy y=xβ+ϵy=xβ+ϵ y = x \beta + \epsilon Мой набор данных сложен, так как все числа в имеют форму . Есть ли что-то процедурное при работе с такими данными?( а + б я )yyy(a+bi)(a+bi)(a + bi) Я спрашиваю, потому что вы в …

31 regression  anova  data-transformation  complex-numbers 

Я пытаюсь проанализировать некоторые данные, используя модель смешанного эффекта. Собранные мной данные показывают вес некоторых молодых животных с различным генотипом с течением времени. Я использую предлагаемый здесь подход: https://gribblelab.wordpress.com/2009/03/09/repeated-measures-anova-using-r/ В частности я использую решение № 2 Так у меня что то типа require(nlme) model <- lme(weight ~ time * Genotype, …

31 r  anova  mixed-model  multiple-comparisons  repeated-measures 

Надеюсь, что это вопрос, который кто-то здесь может ответить для меня о природе разложения сумм квадратов из модели смешанных эффектов lmer(из пакета lme4 R). Прежде всего я должен сказать, что мне известно о противоречиях с использованием этого подхода, и на практике я бы с большей вероятностью использовал загрузочный LRT для …

30 r  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Возможно ли для одностороннего (с группами или «уровнями») ANOVA сообщить о существенной разнице, когда ни один из парных t-тестов не делает?N ( N - 1 ) / 2N> 2N>2N>2N( N- 1 ) / 2N(N−1)/2N(N-1)/2 В этом ответе @whuber писал: Хорошо известно, что глобальный тест ANOVA F может обнаружить разницу средних …

29 statistical-significance  anova  t-test  post-hoc 

Закрыто. Этот вопрос не по теме . В настоящее время не принимает ответы. Хотите улучшить этот вопрос? Обновите вопрос, чтобы он соответствовал теме перекрестной проверки. Закрыто 2 года назад . Я использую каретку, чтобы запустить перекрестный проверенный случайный лес по набору данных. Переменная Y является фактором. В моем наборе данных …

29 r  random-forest  caret  regression  prediction  fitting  social-science  poisson-distribution  distributions  characteristic-function  bayesian  prior  regression  normal-distribution  interaction  nonparametric  skewness  svm  standard-deviation  standard-error  regression-coefficients  igraph  natural-language  word2vec  word-embeddings  regression  machine-learning  sampling  r  regression  machine-learning  random-forest  ensemble  sampling  unbiased-estimator  proof  estimators  mse  probability  conditional-probability  bayes  anova  missing-data  neural-networks  recommender-system  r  confidence-interval  sample  multiple-imputation  r  time-series  forecasting  mase 

Я хотел бы получить p-значение и величину эффекта независимой категориальной переменной (с несколькими уровнями) - то есть «в целом», а не для каждого уровня в отдельности, как нормальный вывод из lme4R. Это так же, как то, о чем люди сообщают при запуске ANOVA. Как я могу получить это?

28 r  hypothesis-testing  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Я только что наткнулся на эту статью , в которой описывается, как вычислить повторяемость (или надежность, или внутриклассовую корреляцию) измерения с помощью моделирования смешанных эффектов. Код R будет: #fit the model fit = lmer(dv~(1|unit),data=my_data) #obtain the variance estimates vc = VarCorr(fit) residual_var = attr(vc,'sc')^2 intercept_var = attr(vc$id,'stddev')[1]^2 #compute the unadjusted …

28 mixed-model  reliability  intraclass-correlation  repeatability  spss  factor-analysis  survey  modeling  cross-validation  error  curve-fitting  mediation  correlation  clustering  sampling  machine-learning  probability  classification  metric  r  project-management  optimization  svm  python  dataset  quality-control  checking  clustering  distributions  anova  factor-analysis  exponential  poisson-distribution  generalized-linear-model  deviance  machine-learning  k-nearest-neighbour  r  hypothesis-testing  t-test  r  variance  levenes-test  bayesian  software  bayesian-network  regression  repeated-measures  least-squares  change-scores  variance  chi-squared  variance  nonlinear-regression  regression-coefficients  multiple-comparisons  p-value  r  statistical-significance  excel  sampling  sample  r  distributions  interpretation  goodness-of-fit  normality-assumption  probability  self-study  distributions  references  theory  time-series  clustering  econometrics  binomial  hypothesis-testing  variance  t-test  paired-comparisons  statistical-significance  ab-test  r  references  hypothesis-testing  t-test  normality-assumption  wilcoxon-mann-whitney  central-limit-theorem  t-test  data-visualization  interactive-visualization  goodness-of-fit 

В чем разница между повторным измерением ANOVA над каким-либо фактором (скажем, экспериментальным условием) и MANOVA? В частности, один веб-сайт, на который я наткнулся, предположил, что MANOVA не делает того же предположения о сферичности, что и повторные измерения ANOVA, верно? Если так, то почему бы не всегда использовать MANOVA? Я пытаюсь …

26 anova  repeated-measures  manova  sphericity 

Пожалуйста, предоставьте R код, который позволяет проводить ANOVA между субъектами с -3, -1, 1, 3 контрастами. Я понимаю, что есть спор относительно соответствующего типа суммы квадратов (SS) для такого анализа. Однако тип SS по умолчанию, используемый в SAS и SPSS (тип III), считается стандартом в моей области. Поэтому я хотел …

26 r  anova  contrasts  sums-of-squares 

lmerTestПакет предоставляет anova()функцию для линейных смешанных моделей с необязательно приближением Саттервейта ( по умолчанию) или Кенворд-Роже степеней свободы (DF). В чем разница между этими двумя подходами? Когда выбрать какой?

25 r  anova  mixed-model  lme4-nlme  degrees-of-freedom 

ANOVA против множественной линейной регрессии? Я понимаю, что оба эти метода, похоже, используют одну и ту же статистическую модель. Однако при каких обстоятельствах я должен использовать какой метод? Каковы преимущества и недостатки этих методов при сравнении? Почему ANOVA так часто используется в экспериментальных исследованиях, а я вряд ли когда-нибудь найду …

24 anova  multiple-regression  least-squares