Вопросы с тегом «survival»

Я пытался понять, что именно означает "coef" и "(exp) coef" coxph. Кажется, что "(exp) coef" - сравнение первой переменной в модели в соответствии с группой, назначенной в команде. Как функция coxph получает значения для "coef" и "(exp) coef"? Кроме того, как coxph определяет эти значения, когда проводится цензура?

14 r  survival  interpretation 

Я знаю, что традиционные статистические модели, такие как регрессия пропорциональных рисков Кокса и некоторые модели Каплана-Мейера, могут использоваться для прогнозирования дней до следующего возникновения события, скажем, провала и т. Д., Т. Е. Анализа выживания Вопросов Как можно использовать регрессионную версию моделей машинного обучения, таких как GBM, нейронные сети и т. …

13 machine-learning  classification  survival  cox-model  kaplan-meier 

Я читал о том, что такое цензура и как ее следует учитывать при анализе выживания, но мне хотелось бы услышать менее математическое определение и более интуитивное определение (картинки были бы хорошими!). Может ли кто-нибудь дать мне объяснение 1) цензуры и 2) как это влияет на такие вещи, как кривые Каплана-Мейера …

13 survival  cox-model  censoring 

В « Стратегиях регрессионного моделирования » Харрелла (второе издание) есть раздел (S. 20.1.7), в котором обсуждаются модели Кокса, включая взаимодействие между ковариатой, основное влияние которой на выживаемость мы также хотим оценить (возраст в примере ниже) и ковариация, основной эффект которой мы не хотим оценивать (пол в примере ниже). Конкретно: предположим, …

13 survival  cox-model  stratification 

Может кто-нибудь объяснить мне мою модель Кокса на простом английском? Я использовал следующую модель регрессии Кокса для всех моих данных, используя cphфункцию. Мои данные сохраняются в объекте под названием Data. Переменные w, xи yнепрерывны; zэто фактор двух уровней. Время измеряется месяцами. У некоторых из моих пациентов отсутствуют данные для переменной …

13 r  cross-validation  survival  cox-model 

Насколько я понимаю, отношение рисков из модели пропорциональных рисков Кокса сравнивает влияние на степень опасности данного фактора с контрольной группой. Как бы вы сообщили об этом аудитории, которая не знает статистику? Попробуем привести пример. Скажем, мы включаем людей в исследование того, как долго они покупают диван. У нас право на …

13 survival  cox-model 

Я занимался настройкой модели caret, но затем перезапустил модель, используя gbmпакет. Насколько я понимаю, caretпакет использует gbmи вывод должен быть одинаковым. Тем не менее, только быстрый запуск теста data(iris)показывает несоответствие в модели около 5% с использованием RMSE и R ^ 2 в качестве метрики оценки. Я хочу найти оптимальную производительность …

13 r  caret  gbm  matrix  linear-algebra  logistic  modeling  logit  ordered-logit  r  confidence-interval  survival  population  weibull  classification  separation  hypothesis-testing  correlation  statistical-significance  p-value  python  r  data-visualization  r  regression  multiple-regression  chi-squared  multivariate-analysis  distributions  random-variable  experiment-design  distributions  poisson-regression  residuals  excel  time-series  garch  var  survival  modeling  cox-model  interaction  r  pca  normality-assumption 

В данном конкретном случае я имею в виду день замерзания озера. Эта дата «обледенения» встречается только один раз в год, но иногда вообще не происходит (если зима теплая). Таким образом, в один год озеро может замерзнуть в день 20 (20 января), а в другой год оно может вообще не замерзнуть. …

13 regression  time-series  survival  data-transformation  recurrent-events 

Я хочу вычислить предсказанную функцию выживания для модели пропорциональных рисков Кокса с ненадежными терминами [используя пакет выживания]. Похоже, что когда в модели присутствуют слабые члены, предсказанная функция выживания не может быть вычислена. ## Example require(survival) data(rats) ## Create fake weight set.seed(90989) rats$weight<-runif(nrow(rats),0.2,0.9) ## Cox model with gamma frailty on litter …

13 r  survival  cox-model  frailty 

Я работаю над классической проблемой прогнозирования оттока, используя количество посещений сайта данным пользователем, и я подумал, что регрессия Пуассона была подходящим инструментом для моделирования будущего вовлечения этого пользователя. Когда я наткнулся на книгу об анализе выживания и моделировании рисков, я не знаю, какая техника лучше. Я не хочу исследовать обе …

13 survival  hazard  poisson-process 

Мне нужно оценить базовую функцию риска λ0( т )λ0(T)\lambda_0(t) в зависящей от времени модели Кокса λ ( t ) = λ0( т ) опыт( Z( т )'β)λ(T)знак равноλ0(T)ехр⁡(Z(T)'β)\lambda(t) = \lambda_0(t) \exp(Z(t)'\beta) Хотя я проходил курс «Выживание», я помню, что прямая производная функции кумулятивной опасности ( ) не была бы хорошей …

13 r  survival  cox-model 

Заранее извиняюсь, если какая-либо терминология, которую я использую, неверна. Я бы приветствовал любое исправление. Если то, что я называю «отсечкой», носит другое имя, дайте мне знать, и я смогу обновить вопрос. Интересующая меня ситуация такова: у вас есть независимые переменные и одна зависимая переменная . Я оставлю это расплывчатым, но …

12 regression  modeling  survival  censoring 

Я хочу сравнить два разных метода для определения изменения статуса в анализе выживания. Группа испытуемых прослеживается в течение более длительного периода (много лет), и для проверки того, произошло ли изменение статуса, использовались два метода исследования; один метод использовался для изучения каждого предмета два раза в год, а второй - для …

12 survival  paired-data 

Примечание: этот вопрос является репостом, так как мой предыдущий вопрос пришлось удалить по юридическим причинам. Сравнивая PROC MIXED из SAS с функцией lmeиз nlmeпакета в R, я наткнулся на некоторые довольно запутанные различия. Более конкретно, степени свободы в разных тестах различаются между PROC MIXEDи lme, и я задавался вопросом, почему. …

12 r  mixed-model  sas  degrees-of-freedom  pdf  unbiased-estimator  distance-functions  functional-data-analysis  hellinger  time-series  outliers  c++  relative-risk  absolute-risk  rare-events  regression  t-test  multiple-regression  survival  teaching  multiple-regression  regression  self-study  t-distribution  machine-learning  recommender-system  self-study  binomial  standard-deviation  data-visualization  r  predictive-models  pearson-r  spearman-rho  r  regression  modeling  r  categorical-data  data-visualization  ggplot2  many-categories  machine-learning  cross-validation  weka  microarray  variance  sampling  monte-carlo  regression  cross-validation  model-selection  feature-selection  elastic-net  distance-functions  information-theory  r  regression  mixed-model  random-effects-model  fixed-effects-model  dataset  data-mining 

Я смотрю на среднюю выживаемость, используя Каплан-Мейер в разных штатах для типа рака. Между штатами довольно большие различия. Как я могу сравнить медианное выживание между всеми штатами и определить, какие из них значительно отличаются от среднего медианного выживания по всей стране?

12 multiple-comparisons  survival