Вопросы с тегом «permutation-test»

Я пытаюсь понять разницу между различными методами передискретизации (симуляция Монте-Карло, параметрическая начальная загрузка, непараметрическая начальная загрузка, джекнифинг, перекрестная проверка, рандомизационные тесты и тесты перестановок) и их реализацией в моем собственном контексте с использованием R. Скажем, у меня следующая ситуация - я хочу выполнить ANOVA с переменной Y ( Yvar) и …

75 r  bootstrap  resampling  jackknife  permutation-test 

У меня есть несколько сотен измерений. Теперь я рассматриваю возможность использования какого-либо программного обеспечения для сопоставления каждой меры с каждой мерой. Это означает, что существуют тысячи корреляций. Среди них (статистически) должна быть высокая корреляция, даже если данные полностью случайны (каждая мера имеет только около 100 точек данных). Когда я нахожу …

66 correlation  multiple-comparisons  permutation-test 

У меня есть данные из эксперимента, которые я проанализировал с помощью t-тестов. Зависимая переменная масштабируется по интервалу, а данные либо непарные (т. Е. 2 ​​группы), либо парные (т. Е. Внутри-субъекты). Например (в рамках предметов): x1 <- c(99, 99.5, 65, 100, 99, 99.5, 99, 99.5, 99.5, 57, 100, 99.5, 99.5, 99, …

56 r  t-test  nonparametric  permutation-test 

Существует несколько популярных методов передискретизации, которые часто используются на практике, такие как начальная загрузка, тест перестановки, складной нож и т. Д. Об этих методах рассказывается множество статей и книг, например, Philip I Good (2010) Permutation, Parametric и Bootstrap Tests гипотез Мой вопрос заключается в том, какая техника повторной выборки приобрела …

37 hypothesis-testing  nonparametric  bootstrap  permutation-test 

Я использую пакет «boot» для вычисления приблизительного 2-стороннего загрузочного p-значения, но результат слишком далек от p-значения при использовании t.test. Я не могу понять, что я сделал неправильно в моем коде R. Может кто-нибудь, пожалуйста, дайте мне подсказку для этого time = c(14,18,11,13,18,17,21,9,16,17,14,15, 12,12,14,13,6,18,14,16,10,7,15,10) group=c(rep(1:2, each=12)) sleep = data.frame(time, group) require(boot) …

28 r  hypothesis-testing  p-value  bootstrap  permutation-test 

Читая CV на все времена, я натолкнулся на утверждение, которое хотел бы уточнить. Это пост, и мой вопрос относится к заключительным замечаниям: «Я должен отметить, что все знания, которые я только что передал, несколько устарели; теперь, когда у нас есть компьютеры, мы можем делать лучше, чем t-тесты. Как отмечает Фрэнк, …

25 hypothesis-testing  t-test  permutation-test  wilcoxon-mann-whitney 

Часто утверждается, что тесты перестановок не имеют никаких предположений, однако это, безусловно, не так. Например, если мои образцы как-то коррелируют, я могу представить, что перестановка их меток не будет правильной вещью. Единственное, что я обнаружил в этой проблеме, - это предложение из Википедии: «Важное предположение, стоящее за тестом перестановки, заключается …

22 hypothesis-testing  permutation-test  resampling 

Предположим, у меня есть данные с двумя независимыми группами: g1.lengths <- c (112.64, 97.10, 84.18, 106.96, 98.42, 101.66) g2.lengths <- c (84.44, 82.10, 83.26, 81.02, 81.86, 86.80, 85.84, 97.08, 79.64, 83.32, 91.04, 85.92, 73.52, 85.58, 97.70, 89.72, 88.92, 103.72, 105.02, 99.48, 89.50, 81.74) group = rep (c ("g1", "g2"), c …

18 r  hypothesis-testing  bootstrap  small-sample  permutation-test 

У меня есть набор данных с десятками тысяч наблюдений за данными о медицинских расходах. Эти данные сильно искажены вправо и имеют много нулей. Это выглядит так для двух групп людей (в данном случае две возрастные группы с> 3000 человек в каждой): Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max. 0.0 …

18 t-test  skewness  permutation-test 

У меня есть два набора данных, и я хотел бы знать, значительно ли они различаются или нет (это происходит из « Две группы существенно различаются? Тест для использования »). Я решил использовать тест перестановки, выполнив в R следующее: permutation.test <- function(coding, lncrna) { coding <- coding[,1] # dataset1 lncrna <- …

15 p-value  permutation-test 

Тесты перестановки (также называемые тестом рандомизации, тестом повторной рандомизации или точным тестом) очень полезны и оказываются полезными, когда предположение о нормальном распределении, требуемое, например, t-testне выполняется, и когда преобразование значений путем ранжирования непараметрическое тестирование, как, Mann-Whitney-U-testможет привести к потере большего количества информации. Тем не менее, одно и только одно предположение …

15 hypothesis-testing  permutation-test  exchangeability  r  statistical-significance  loess  data-visualization  normal-distribution  pdf  ggplot2  kernel-smoothing  probability  self-study  expected-value  normal-distribution  prior  correlation  time-series  regression  heteroscedasticity  estimation  estimators  fisher-information  data-visualization  repeated-measures  binary-data  panel-data  mathematical-statistics  coefficient-of-variation  normal-distribution  order-statistics  regression  machine-learning  one-class  probability  estimators  forecasting  prediction  validation  finance  measurement-error  variance  mean  spatial  monte-carlo  data-visualization  boxplot  sampling  uniform  chi-squared  goodness-of-fit  probability  mixture  theory  gaussian-mixture  regression  statistical-significance  p-value  bootstrap  regression  multicollinearity  correlation  r  poisson-distribution  survival  regression  categorical-data  ordinal-data  ordered-logit  regression  interaction  time-series  machine-learning  forecasting  cross-validation  binomial  multiple-comparisons  simulation  false-discovery-rate  r  clustering  frequency  wilcoxon-mann-whitney  wilcoxon-signed-rank  r  svm  t-test  missing-data  excel  r  numerical-integration  r  random-variable  lme4-nlme  mixed-model  weighted-regression  power-law  errors-in-variables  machine-learning  classification  entropy  information-theory  mutual-information 

В литературе термины Рандомизация и Перестановка используются взаимозаменяемо. Со многими авторами констатируют «тесты перестановки (или рандомизации)», или наоборот. В лучшем случае я считаю, что разница невелика, и она заключается в их предположениях о данных и возможных выводах, которые можно сделать. Мне просто нужно проверить, правильно ли мое понимание или есть …

15 hypothesis-testing  sampling  terminology  permutation-test 

Недавно я искал способы повторной выборки временных рядов таким образом, чтобы Приблизительно сохраняйте автокорреляцию длительных процессов памяти. Сохраните область наблюдений (например, пересчитанный временной ряд целых чисел все еще является временным рядом целых чисел). Может влиять только на некоторые весы, если требуется. Я придумал следующую схему перестановок для временного ряда длиной …

14 time-series  bootstrap  resampling  permutation-test 

Я сейчас изучаю рандомизированные тесты. Мне на ум приходят два вопроса: Да, легко и интуитивно понятно, как значение p вычисляется с помощью теста рандомизации (который, я думаю, совпадает с тестом перестановки?). Тем не менее, как мы можем также генерировать 95% доверительный интервал, как мы делаем с обычными параметрическими тестами? Когда …

12 confidence-interval  p-value  permutation-test 

У меня есть две категориальные / номинальные переменные. Каждое из них может принимать только два разных значения (итого, у меня всего 4 комбинации). Каждая комбинация значений поставляется с набором числовых значений. Итак, у меня есть 4 набора чисел. Чтобы сделать его более конкретным, допустим, что у меня есть male / …

10 hypothesis-testing  p-value  nonparametric  permutation-test