Вопросы с тегом «sequence-analysis»

Энтропия Шеннона является отрицательной суммой вероятностей каждого результата, умноженной на логарифм вероятностей для каждого результата. Какой цели служит логарифм в этом уравнении? Интуитивно понятный или визуальный ответ (в отличие от глубоко математического ответа) получит бонусные баллы!

72 entropy  intuition  sequence-analysis 

Отрицательное биномиальное распределение стало популярной моделью для подсчета данных (в частности, ожидаемое количество считываний секвенирования в пределах данной области генома из данного эксперимента) в биоинформатике. Объяснения различаются: Некоторые объясняют это как то, что работает как распределение Пуассона, но имеет дополнительный параметр, предоставляющий больше свободы для моделирования истинного распределения с дисперсией, …

16 poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis 

У меня есть GLMM формы: lmer(present? ~ factor1 + factor2 + continuous + factor1*continuous + (1 | factor3), family=binomial) Когда я использую drop1(model, test="Chi"), я получаю другие результаты, чем если бы я использовал Anova(model, type="III")из пакета автомобиля или summary(model). Последние два дают одинаковые ответы. Используя кучу сфабрикованных данных, я обнаружил, …

10 r  anova  glmm  r  mixed-model  bootstrap  sample-size  cross-validation  roc  auc  sampling  stratification  random-allocation  logistic  stata  interpretation  proportion  r  regression  multiple-regression  linear-model  lm  r  cross-validation  cart  rpart  logistic  generalized-linear-model  econometrics  experiment-design  causality  instrumental-variables  random-allocation  predictive-models  data-mining  estimation  contingency-tables  epidemiology  standard-deviation  mean  ancova  psychology  statistical-significance  cross-validation  synthetic-data  poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis  distributions  binomial  classification  k-means  distance  unsupervised-learning  euclidean  correlation  chi-squared  spearman-rho  forecasting  excel  exponential-smoothing  binomial  sample-size  r  change-point  wilcoxon-signed-rank  ranks  clustering  matlab  covariance  covariance-matrix  normal-distribution  simulation  random-generation  bivariate  standardization  confounding  z-statistic  forecasting  arima  minitab  poisson-distribution  negative-binomial  poisson-regression  overdispersion  probability  self-study  markov-process  estimation  maximum-likelihood  classification  pca  group-differences  chi-squared  survival  missing-data  contingency-tables  anova  proportion 

Ситуация: две птицы (самец и самка) защищают свои яйца в гнезде от злоумышленника. Каждая птица может использовать для защиты либо атаку, либо угрозу, а также присутствовать или отсутствовать. Из данных возникает закономерность, что поведение может быть взаимодополняющим - атаки мужчин, в то время как женщины используют отображение угроз, и наоборот. …

10 r  sequence-analysis