Вопросы с тегом «r»

Я только что наткнулся на эту статью , в которой описывается, как вычислить повторяемость (или надежность, или внутриклассовую корреляцию) измерения с помощью моделирования смешанных эффектов. Код R будет: #fit the model fit = lmer(dv~(1|unit),data=my_data) #obtain the variance estimates vc = VarCorr(fit) residual_var = attr(vc,'sc')^2 intercept_var = attr(vc$id,'stddev')[1]^2 #compute the unadjusted …

28 mixed-model  reliability  intraclass-correlation  repeatability  spss  factor-analysis  survey  modeling  cross-validation  error  curve-fitting  mediation  correlation  clustering  sampling  machine-learning  probability  classification  metric  r  project-management  optimization  svm  python  dataset  quality-control  checking  clustering  distributions  anova  factor-analysis  exponential  poisson-distribution  generalized-linear-model  deviance  machine-learning  k-nearest-neighbour  r  hypothesis-testing  t-test  r  variance  levenes-test  bayesian  software  bayesian-network  regression  repeated-measures  least-squares  change-scores  variance  chi-squared  variance  nonlinear-regression  regression-coefficients  multiple-comparisons  p-value  r  statistical-significance  excel  sampling  sample  r  distributions  interpretation  goodness-of-fit  normality-assumption  probability  self-study  distributions  references  theory  time-series  clustering  econometrics  binomial  hypothesis-testing  variance  t-test  paired-comparisons  statistical-significance  ab-test  r  references  hypothesis-testing  t-test  normality-assumption  wilcoxon-mann-whitney  central-limit-theorem  t-test  data-visualization  interactive-visualization  goodness-of-fit 

Полезно изучить код анализа данных экспертов. Недавно я просматривал github, и многие люди делятся там кодом анализа данных. Это включает в себя несколько пакетов R (которые, конечно, доступны непосредственно из CRAN), а также несколько примеров воспроизводимых исследований, особенно с использованием R ( см. Этот список R на github ). Кто …

28 r  reproducible-research 

Я использую пакет «boot» для вычисления приблизительного 2-стороннего загрузочного p-значения, но результат слишком далек от p-значения при использовании t.test. Я не могу понять, что я сделал неправильно в моем коде R. Может кто-нибудь, пожалуйста, дайте мне подсказку для этого time = c(14,18,11,13,18,17,21,9,16,17,14,15, 12,12,14,13,6,18,14,16,10,7,15,10) group=c(rep(1:2, each=12)) sleep = data.frame(time, group) require(boot) …

28 r  hypothesis-testing  p-value  bootstrap  permutation-test 

Большинство стандартных дистрибутивов в R имеют семейство команд - pdf / pmf, cdf / cmf, квантиль, случайные отклонения (например, dnorm, pnorm, qnorm, rnorm). Я знаю, что достаточно просто использовать некоторые стандартные команды для воспроизведения этих функций для дискретных равномерных распределений, но есть ли уже предпочтительное встроенное семейство функций для моделирования …

28 r  distributions  uniform 

Если вспомнить, когда вы впервые начали анализ временных рядов. Какие инструменты, пакеты R и интернет-ресурсы вы хотели бы знать? Я пытаюсь спросить: с чего начать? В частности, есть ли ресурсы для R, которые действительно сводят его к тому, кто «новичок» в анализе временных рядов с R.

28 r  time-series 

У меня есть R-скрипты для чтения больших объемов данных CSV из разных файлов, а затем выполнять задачи машинного обучения, такие как SVM для классификации. Существуют ли какие-либо библиотеки для использования нескольких ядер на сервере R. или Каков наиболее подходящий способ достижения этого?

28 r  parallel-computing  multicore 

Locked . Этот вопрос и его ответы заблокированы, потому что вопрос не по теме, но имеет историческое значение. В настоящее время он не принимает новые ответы или взаимодействия. Повторяющаяся тема: Я только что установил последнюю версию R. Какие пакеты я должен получить? Какие пакеты R вы не могли себе представить …

28 r 

У меня есть набор данных с 9 непрерывными независимыми переменными. Я пытаюсь выбрать среди этих переменных, чтобы подогнать модель к одной процентной (зависимой) переменной Score. К сожалению, я знаю, что между несколькими переменными будет серьезная коллинеарность. Я пытался использовать stepAIC()функцию в R для выбора переменных, но этот метод, как ни …

28 r  multiple-regression  feature-selection  multicollinearity 

У меня есть матрица, где a (i, j) говорит мне, сколько раз я просмотрел страницу j. Есть 27 тысяч человек и 95 тысяч страниц. Я хотел бы иметь несколько «измерений» или «аспектов» в пространстве страниц, которые соответствуют наборам страниц, которые часто просматриваются вместе. Моя конечная цель состоит в том, чтобы …

28 r  clustering  dimensionality-reduction 

Когда я использую GAM, он дает мне остаточный DF, (последняя строка в коде). Что это значит? Выходя за рамки примера GAM, в общем, может ли число степеней свободы быть нецелым числом?26,626.626.6 > library(gam) > summary(gam(mpg~lo(wt),data=mtcars)) Call: gam(formula = mpg ~ lo(wt), data = mtcars) Deviance Residuals: Min 1Q Median 3Q …

27 r  degrees-of-freedom  gam  machine-learning  pca  lasso  probability  self-study  bootstrap  expected-value  regression  machine-learning  linear-model  probability  simulation  random-generation  machine-learning  distributions  svm  libsvm  classification  pca  multivariate-analysis  feature-selection  archaeology  r  regression  dataset  simulation  r  regression  time-series  forecasting  predictive-models  r  mean  sem  lavaan  machine-learning  regularization  regression  conv-neural-network  convolution  classification  deep-learning  conv-neural-network  regression  categorical-data  econometrics  r  confirmatory-factor  scale-invariance  self-study  unbiased-estimator  mse  regression  residuals  sampling  random-variable  sample  probability  random-variable  convergence  r  survival  weibull  references  autocorrelation  hypothesis-testing  distributions  correlation  regression  statistical-significance  regression-coefficients  univariate  categorical-data  chi-squared  regression  machine-learning  multiple-regression  categorical-data  linear-model  pca  factor-analysis  factor-rotation  classification  scikit-learn  logistic  p-value  regression  panel-data  multilevel-analysis  variance  bootstrap  bias  probability  r  distributions  interquartile  time-series  hypothesis-testing  normal-distribution  normality-assumption  kurtosis  arima  panel-data  stata  clustered-standard-errors  machine-learning  optimization  lasso  multivariate-analysis  ancova  machine-learning  cross-validation 

У меня есть матрица из 336x256 чисел с плавающей запятой (336 бактериальных геномов (столбцы) x 256 нормализованных частот тетрануклеотидов (ряды), например, каждый столбец добавляет до 1). Я получаю хорошие результаты, когда выполняю анализ с использованием принципного анализа компонентов. Сначала я вычисляю кластеры kmeans на данных, затем запускаю PCA и раскрашиваю …

27 r  pca  tsne 

В arimaфункции в R, то , что делает order(1, 0, 12)среднее? Каковы ценности , которые могут быть назначены p, d, qи что этот процесс , чтобы найти эти значения?

27 r  time-series  arima 

В многоуровневой модели, каковы практические и связанные с интерпретацией последствия оценки, а не оценки параметров корреляции случайных эффектов? Практическая причина спрашивать это состоит в том, что в структуре Лмера в R нет реализованного метода для оценки p-значений с помощью методов MCMC, когда оценки делаются в модели корреляций между параметрами. Например, …

27 r  mixed-model  lme4-nlme  random-effects-model 

Хотя я знаю, что существует ряд функций для генерации тепловых карт в R, проблема в том, что я не могу создавать визуально привлекательные карты. Например, изображения ниже являются хорошими примерами тепловых карт, которых я хочу избежать. В первом явно не хватает деталей, а в другом (основанном на тех же пунктах) …

27 r  data-visualization  spatial 

Закрыто. Этот вопрос не по теме . В настоящее время не принимает ответы. Хотите улучшить этот вопрос? Обновите вопрос, чтобы он соответствовал теме перекрестной проверки. Закрыто в прошлом году . У меня есть точечный график. Как я могу добавить нелинейную линию тренда?

27 r  data-visualization  nonlinear-regression  trend