Вопросы с тегом «mixed-model»

Я смотрел на моделирование смешанных эффектов с использованием пакета lme4 в R. Я в основном использую lmerкоманду, поэтому я задам свой вопрос через код, который использует этот синтаксис. Я предполагаю, что общий простой вопрос может состоять в том, можно ли сравнивать любые две модели, построенные с lmerиспользованием отношений правдоподобия на …

20 r  mixed-model  lme4-nlme  likelihood-ratio 

Логика множественного вменения (МИ) состоит в том, чтобы вменять пропущенные значения не один раз, а несколько (обычно М = 5) раз, что приводит к М завершенным наборам данных. Затем M завершенных наборов данных анализируются с использованием методов полных данных, на которых M оценок и их стандартные ошибки объединяются с использованием …

20 modeling  confidence-interval  mixed-model  data-imputation 

Точность определяется как: p = true positives / (true positives + false positives) Является ли это исправить , что, как true positivesи false positivesподход 0, точность приближается к 1? Тот же вопрос для отзыва: r = true positives / (true positives + false negatives) В настоящее время я выполняю статистический …

20 precision-recall  data-visualization  logarithm  references  r  networks  data-visualization  standard-deviation  probability  binomial  negative-binomial  r  categorical-data  aggregation  plyr  survival  python  regression  r  t-test  bayesian  logistic  data-transformation  confidence-interval  t-test  interpretation  distributions  data-visualization  pca  genetics  r  finance  maximum  probability  standard-deviation  probability  r  information-theory  references  computational-statistics  computing  references  engineering-statistics  t-test  hypothesis-testing  independence  definition  r  censoring  negative-binomial  poisson-distribution  variance  mixed-model  correlation  intraclass-correlation  aggregation  interpretation  effect-size  hypothesis-testing  goodness-of-fit  normality-assumption  small-sample  distributions  regression  normality-assumption  t-test  anova  confidence-interval  z-statistic  finance  hypothesis-testing  mean  model-selection  information-geometry  bayesian  frequentist  terminology  type-i-and-ii-errors  cross-validation  smoothing  splines  data-transformation  normality-assumption  variance-stabilizing  r  spss  stata  python  correlation  logistic  logit  link-function  regression  predictor  pca  factor-analysis  r  bayesian  maximum-likelihood  mcmc  conditional-probability  statistical-significance  chi-squared  proportion  estimation  error  shrinkage  application  steins-phenomenon 

Мы знаем, что парное t- тестирование - это всего лишь частный случай одностороннего повторного измерения (или внутри субъекта) ANOVA, а также линейной модели смешанного эффекта, которую можно продемонстрировать с помощью функции lme () пакета nlme в R как показано ниже. #response data from 10 subjects under two conditions x1<-rnorm(10) x2<-1+rnorm(10) …

20 r  mixed-model  t-test  repeated-measures  lme4-nlme 

Рассмотрим следующие данные из двустороннего дизайна предметов: df <- "http://personality-project.org/r/datasets/R.appendix4.data" df <- read.table(df,header=T) head(df) Observation Subject Task Valence Recall 1 1 Jim Free Neg 8 2 2 Jim Free Neu 9 3 3 Jim Free Pos 5 4 4 Jim Cued Neg 7 5 5 Jim Cued Neu 9 6 …

19 mixed-model  repeated-measures  model-selection  lme4-nlme  likelihood-ratio 

Скажем, мы должны GLMMs mod1 <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) mod2 <- glmer(y ~ x + B + (1|g), data = dat) Эти модели не являются вложенными в обычном смысле: a <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) b <- …

19 r  mixed-model  aic  lme4-nlme  nested-models 

Скажем, мы работаем над моделью случайных эффектов некоторых данных подсчета во времени, и мы хотим контролировать некоторые тенденции. Обычно вы делаете что-то вроде: lmer(counts ~ dependent_variable + (1+t+I(t^2)|ID), family="poisson") включить квадратную форму для t. Можно ли использовать более сложные методы сглаживания, такие как сглаживание по УХОДУ или сплайны, для моделирования …

19 mixed-model  lme4-nlme  splines 

Есть различие, которое сбивает меня с толку смешанными моделями, и мне интересно, смогу ли я получить некоторую ясность в этом. Предположим, у вас смешанная модель данных подсчета. Есть переменная с фиксированным эффектом (A) и другая переменная времени (T), сгруппированные, скажем, в переменную «Site». Как я понимаю: glmer(counts ~ A + …

19 r  mixed-model  lme4-nlme 

В основном меня интересует, как применяются различные ковариационные структуры и как рассчитываются значения внутри этих матриц. Такие функции, как lme (), позволяют нам выбирать, какую структуру мы бы хотели, но я бы хотел знать, как они оцениваются. Рассмотрим модель линейных смешанных эффектов .Y= Xβ+ Zu+ϵY=Xβ+Zu+ϵY=X\beta+Zu+\epsilon Где и . Более того:ε …

19 mixed-model  random-effects-model  covariance  covariance-matrix 

Я пытаюсь использовать lmeиз nlmeпакета, чтобы повторить результаты aovдля повторных мер ANOVA. Я сделал это для однофакторного эксперимента с повторными измерениями и для двухфакторного эксперимента с одним фактором между субъектами и одним фактором внутри субъекта, но у меня возникли проблемы с выполнением этого для двухфакторного эксперимента с двумя внутри -субъектные …

19 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

Я пытаюсь создать модель, для которой у меня есть переменная ответа, которая составляет пропорцию между 0 и 1, это включает довольно много 0 и 1, но также и много значений между ними. Я думаю о попытке бета-регрессии. Пакет, который я нашел для R (betareg), допускает только значения в диапазоне от …

19 regression  mixed-model  beta-distribution  zero-inflation  beta-regression 

Пожалуйста, рассмотрите эти данные: dt.m <- structure(list(id = c(1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12), occasion = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, …

19 r  mixed-model  stata  lme4-nlme 

В ответ на этот вопрос относительно того, был ли мой дизайн, в котором я случайно представил участников с изображениями из разных категорий, примером, в котором я должен использовать повторные измерения ANOVA, я получил ответ, что вместо этого я должен использовать смешанную модель с одним из причины в том, что у …

19 anova  mixed-model  repeated-measures 

Могу ли я получить помощь в завершении этой пробной (находящейся в процессе) попытки получить ориентиры по эквивалентам ANOVA и REGRESSION? Я пытался согласовать понятия, номенклатуру и синтаксис этих двух методологий. На этом сайте есть много сообщений об их общности, например, об этом или об этом , но все же хорошо …

18 regression  anova  mixed-model 

Я пролистал несколько книг (Raudenbush & Bryk, Snijders & Bosker, Gelman & Hill и т. Д.) И несколько статей (Gelman, Jusko, Primo & Jacobsmeier и т. Д.), И я до сих пор не успокоился основные различия между использованием кластерных стандартных ошибок стихов многоуровневого моделирования. Я понимаю те части, которые связаны …

18 mixed-model  multilevel-analysis  clustered-standard-errors