Вопросы с тегом «r»

Каковы некоторые полезные рекомендации для тестирования параметров (например, глубина взаимодействия, minchild, частота выборки и т. Д.) С использованием GBM? Допустим, у меня 70-100 функций, население 200 000, и я собираюсь проверить глубину взаимодействия 3 и 4. Очевидно, мне нужно провести некоторое тестирование, чтобы увидеть, какая комбинация параметров лучше всего подходит …

31 r  hypothesis-testing  cart  boosting 

Я хочу создать сюжет, описанный в книге ElemStatLearn «Элементы статистического обучения: сбор данных, вывод и прогноз. Второе издание» Тревора Хасти, Роберта Тибширани и Джерома Фридмана. Сюжет: Мне интересно, как я могу получить этот точный график R, особенно обратите внимание на графику сетки и расчеты, чтобы показать границу.

31 r  data-visualization  k-nearest-neighbour 

Можно ли визуализировать результаты анализа основных компонентов способами, которые дают больше понимания, чем просто сводные таблицы? Возможно ли это сделать, когда число наблюдений велико, скажем, ~ 1e4? И возможно ли это сделать в R [приветствуются другие среды]?

31 r  data-visualization  pca  biplot 

Я нашел несколько дистрибутивов, для которых BUGS и R имеют разные параметризации: Normal, log-Normal и Weibull. Для каждого из них я понимаю, что второй параметр, используемый R, необходимо преобразовать в обратном направлении (1 / параметр), прежде чем использовать в BUGS (или в моем случае JAGS). Кто-нибудь знает исчерпывающий список этих …

31 r  distributions  bugs  jags  parameterization 

Я пытаюсь проанализировать некоторые данные, используя модель смешанного эффекта. Собранные мной данные показывают вес некоторых молодых животных с различным генотипом с течением времени. Я использую предлагаемый здесь подход: https://gribblelab.wordpress.com/2009/03/09/repeated-measures-anova-using-r/ В частности я использую решение № 2 Так у меня что то типа require(nlme) model <- lme(weight ~ time * Genotype, …

31 r  anova  mixed-model  multiple-comparisons  repeated-measures 

Контекст: в ответ на предыдущий вопрос о воспроизводимых исследованиях Джейк написал Одна проблема, которую мы обнаружили при создании нашего архива JASA, заключалась в том, что версии и значения по умолчанию пакетов CRAN изменились. Итак, в этот архив мы также включили версии пакетов, которые мы использовали. Система, основанная на виньетировании, вероятно, …

31 r  reproducible-research  project-management 

Я хотел бы определить относительную важность наборов переменных для randomForestмодели классификации в R. importanceФункция предоставляет MeanDecreaseGiniметрику для каждого отдельного предиктора - это так же просто, как суммировать это для каждого предиктора в наборе? Например: # Assumes df has variables a1, a2, b1, b2, and outcome rf <- randomForest(outcome ~ ., …

31 r  machine-learning  classification  random-forest 

Можно ли рассчитать значения AIC или BIC для моделей лассо-регрессии и других регуляризованных моделей, где параметры только частично входят в уравнение. Как определить степени свободы? Я использую R для подбора моделей регрессии Лассо с помощью glmnet()функции из glmnetпакета, и я хотел бы знать, как рассчитать значения AIC и BIC для …

31 r  model-selection  lasso  aic  bic 

Обобщенными аддитивными моделями являются те, где Y= α + f1( х1) + f2( х2) + еяy=α+f1(x1)+f2(x2)+ei y = \alpha + f_1(x_1) + f_2(x_2) + e_i например. функции гладкие и должны быть оценены. Обычно по штрафным сплайнам. MGCV - это пакет в R, который делает это, и автор (Саймон Вуд) пишет …

31 r  nonparametric  interaction  splines  intuition 

Я пытаюсь составить график количества действий пользователей (в данном случае «лайков») с течением времени. Таким образом, у меня есть «Количество действий» в качестве моей оси Y, моя ось X - время (недели), и каждая строка представляет одного пользователя. Моя проблема в том, что я хочу посмотреть на эти данные около …

31 r  data-visualization 

Я считаю, что R может занять много времени для создания графиков, когда присутствуют миллионы точек - неудивительно, учитывая, что точки строятся индивидуально. Кроме того, такие графики часто слишком загромождены и плотны, чтобы быть полезными. Многие из точек перекрываются и образуют черную массу, и много времени тратится на построение большего количества …

31 r  data-visualization 

Я надеюсь, что кто-то может дать интуитивный обзор того, что такое квазибиномиальное распределение и что оно делает. Меня особенно интересуют эти моменты: Чем квазибиномиал отличается от биномиального распределения. Когда переменная отклика представляет собой пропорцию (примерные значения включают 0,23, 0,11, 0,78, 0,98), квазибиномиальная модель будет работать в R, а биномиальная модель …

30 r  generalized-linear-model  binomial  overdispersion  quasi-likelihood 

Надеюсь, что это вопрос, который кто-то здесь может ответить для меня о природе разложения сумм квадратов из модели смешанных эффектов lmer(из пакета lme4 R). Прежде всего я должен сказать, что мне известно о противоречиях с использованием этого подхода, и на практике я бы с большей вероятностью использовал загрузочный LRT для …

30 r  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Мне было интересно, сможет ли кто-нибудь рассказать мне о текущих различиях между этими двумя функциями. Я нашел следующий вопрос: Как выбрать библиотеку nlme или lme4 R для моделей со смешанными эффектами? , но это происходит пару лет назад. Это жизнь в кругах программного обеспечения. Мои конкретные вопросы: Есть ли (все …

30 r  mixed-model  lme4-nlme 

Интересно, существует ли какой-либо статистический тест для «проверки» значимости бимодального распределения. Я имею в виду, насколько мои данные соответствуют бимодальному распределению или нет? Если да, есть ли тест в программе R?

30 r  hypothesis-testing  distributions  bimodal