Вопросы с тегом «lme4-nlme»

Закрыто. Этот вопрос не по теме . В настоящее время не принимает ответы. Хотите улучшить этот вопрос? Обновите вопрос, чтобы он соответствовал теме перекрестной проверки. Закрыто 6 месяцев назад . Я работал в R-пакетах nlme и lme4 , пытаясь указать модели с несколькими случайными эффектами. Я обнаружил, что только nlme …

25 r  random-effects-model  lme4-nlme 

Я пытаюсь перейти от использования ezпакета lmeдля повторных измерений ANOVA (как я надеюсь, я смогу использовать пользовательские контрасты с lme). Следуя совету из этого поста в блоге, я смог настроить одну и ту же модель, используя обе функции aov(как это делается ezпри запросе) и lme. Однако, в то время как …

24 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

Я просматривал этот обзор формул lm / lmer R от @conjugateprior и был озадачен следующей записью: Теперь предположим, что A случайный, но B фиксирован, а B вложен в A. aov(Y ~ B + Error(A/B), data=d) Ниже приведена аналогичная смешанная модельная формула lmer(Y ~ B + (1 | A:B), data=d) для …

23 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

Мне интересно, есть ли какие-либо методы для расчета размера выборки в смешанных моделях? Я использую lmerв R, чтобы соответствовать моделям (у меня есть случайные наклоны и перехваты).

23 r  mixed-model  lme4-nlme  power-analysis 

Мы запустили логистическую регрессию со смешанными эффектами, используя следующий синтаксис; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Предмет и Предмет - случайные эффекты. Мы получаем странный результат: коэффициент и стандартное отклонение для предметного термина равны …

22 r  mixed-model  stata  glmm  lme4-nlme 

Предположим, у меня есть некоторые измерения для каждого предмета на каждом сайте. Две переменные, субъект и сайт, представляют интерес с точки зрения вычисления значений внутриклассовой корреляции (ICC). Обычно я использую функцию lmerиз пакета R lme4и запускаю lmer(measurement ~ 1 + (1 | subject) + (1 | site), mydata) Значения ICC …

22 r  lme4-nlme  intraclass-correlation 

У меня есть эксперимент с повторными измерениями, где зависимая переменная представляет собой процент, и у меня есть несколько факторов в качестве независимых переменных. Я хотел бы использовать glmerиз пакета R, lme4чтобы рассматривать его как проблему логистической регрессии (путем указания family=binomial), так как он, кажется, приспосабливает эту настройку напрямую. Мои данные …

21 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

В следующем наборе данных я хотел посмотреть, изменится ли ответ (эффект) в отношении сайтов, сезона, продолжительности и их взаимодействий. Некоторые онлайн-форумы по статистике предложили мне продолжить работу с линейными моделями со смешанными эффектами, но проблема в том, что, поскольку репликации рандомизированы на каждой станции, у меня мало шансов собрать образец …

21 r  mixed-model  lme4-nlme 

Я работал с некоторыми данными, которые имеют некоторые проблемы с повторными измерениями. При этом я заметил очень различное поведение lme()и lmer()использование моих тестовых данных и хочу знать почему. Поддельный набор данных, который я создал, содержит измерения роста и веса для 10 предметов, взятых дважды каждый. Я настроил данные так, чтобы …

20 r  mixed-model  lme4-nlme 

Я смотрел на моделирование смешанных эффектов с использованием пакета lme4 в R. Я в основном использую lmerкоманду, поэтому я задам свой вопрос через код, который использует этот синтаксис. Я предполагаю, что общий простой вопрос может состоять в том, можно ли сравнивать любые две модели, построенные с lmerиспользованием отношений правдоподобия на …

20 r  mixed-model  lme4-nlme  likelihood-ratio 

Мы знаем, что парное t- тестирование - это всего лишь частный случай одностороннего повторного измерения (или внутри субъекта) ANOVA, а также линейной модели смешанного эффекта, которую можно продемонстрировать с помощью функции lme () пакета nlme в R как показано ниже. #response data from 10 subjects under two conditions x1<-rnorm(10) x2<-1+rnorm(10) …

20 r  mixed-model  t-test  repeated-measures  lme4-nlme 

Рассмотрим следующие данные из двустороннего дизайна предметов: df <- "http://personality-project.org/r/datasets/R.appendix4.data" df <- read.table(df,header=T) head(df) Observation Subject Task Valence Recall 1 1 Jim Free Neg 8 2 2 Jim Free Neu 9 3 3 Jim Free Pos 5 4 4 Jim Cued Neg 7 5 5 Jim Cued Neu 9 6 …

19 mixed-model  repeated-measures  model-selection  lme4-nlme  likelihood-ratio 

Скажем, мы должны GLMMs mod1 <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) mod2 <- glmer(y ~ x + B + (1|g), data = dat) Эти модели не являются вложенными в обычном смысле: a <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) b <- …

19 r  mixed-model  aic  lme4-nlme  nested-models 

Скажем, мы работаем над моделью случайных эффектов некоторых данных подсчета во времени, и мы хотим контролировать некоторые тенденции. Обычно вы делаете что-то вроде: lmer(counts ~ dependent_variable + (1+t+I(t^2)|ID), family="poisson") включить квадратную форму для t. Можно ли использовать более сложные методы сглаживания, такие как сглаживание по УХОДУ или сплайны, для моделирования …

19 mixed-model  lme4-nlme  splines 

Есть различие, которое сбивает меня с толку смешанными моделями, и мне интересно, смогу ли я получить некоторую ясность в этом. Предположим, у вас смешанная модель данных подсчета. Есть переменная с фиксированным эффектом (A) и другая переменная времени (T), сгруппированные, скажем, в переменную «Site». Как я понимаю: glmer(counts ~ A + …

19 r  mixed-model  lme4-nlme