Вычислительная наука

У кого-нибудь есть рекомендации по использованию удобной и быстрой матрицы библиотеки C ++? Что я подразумеваю под юзабилити - это следующее: Матричные объекты имеют интуитивно понятный интерфейс (например, я могу использовать строки и столбцы при индексации) Я могу сделать что-нибудь с классом матрицы, что я могу сделать с LAPACK и …

158 linear-algebra  software  implicit-methods 

Я твердо убежден в ценности использования тестов, которые проверяют полную программу (например, тесты сходимости), включая автоматизированный набор регрессионных тестов . После прочтения некоторых книг по программированию у меня появилось мучительное чувство, что я "должен" написать модульные тесты (т. Е. Тесты, которые проверяют правильность одной функции и не сводятся к выполнению …

89 programming-paradigms  testing 

Так что я неплохо разбираюсь в том, какие проблемы, с которыми я работаю, являются лучшими в сериале, и которыми можно управлять параллельно. Но сейчас у меня нет особого представления о том, что лучше всего обрабатывать вычислениями на базе ЦП, и что следует выгружать в графический процессор. Я знаю, что это …

84 gpu 

У меня есть несколько сложных невыпуклых задач глобальной оптимизации. В настоящее время я использую MATLAB Optimization Toolbox (в частности, fmincon()с алгоритмом = 'sqp'), что довольно эффективно . Тем не менее, большая часть моего кода написана на Python, и я бы тоже хотел провести оптимизацию на Python. Есть ли решатель НЛП …

77 python  optimization  nonlinear-programming  linear-algebra  linear-solver  sparse-matrix  ode  automatic-differentiation  efficiency  matrix  symbolic-computation  pde  multiphysics  operator-splitting  fluid-dynamics  pde  multigrid  pde  hyperbolic-pde  quadrature  precision  numerical-analysis  fluid-dynamics  interpolation  c  ode  testing  data-sets  pde  fluid-dynamics  hyperbolic-pde  pde  finite-element  fluid-dynamics  stability  incompressible  pde  hyperbolic-pde  fluid-dynamics  pde  precision  floating-point  convex-optimization  conditioning  pde  hyperbolic-pde  stability  implicit-methods  explicit-methods  fluid-dynamics  accuracy  pde  hyperbolic-pde  petsc  linear-algebra 

Этот вопрос является продолжением двух обсуждений, недавно появившихся в ответах на " C ++ против Fortran for HPC ". И это больше вызов, чем вопрос ... Один из наиболее часто звучащих аргументов в пользу Fortran заключается в том, что компиляторы просто лучше. Поскольку большинство компиляторов C / Fortran используют один …

74 fortran  c  blas  benchmarking 

Я работаю в вычислительной науке, и в результате я трачу нетривиальное количество своего времени, пытаясь увеличить научную пропускную способность многих кодов, а также понять эффективность этих кодов. Давайте предположим, что я оценил соотношение производительности и читаемости / возможности повторного использования / обслуживания программного обеспечения, над которым я работаю, и решил, …

66 performance 

В моей программе PhD по вычислительной технике мы работаем почти исключительно на C ++ и Fortran. Кажется, некоторые профессора предпочитают одного другому. Мне интересно, какой из них «лучше» или один лучше другого в определенных обстоятельствах.

56 hpc  fortran  c++  languages 

Преобразование Фурье Быстрый алгоритм вычисляет Фурье разложения в предположении , что его входные точки равномерно распределены во временной области, . Что если они не? Есть ли другой алгоритм, который я мог бы использовать, или каким-то образом я мог бы изменить БПФ, чтобы учесть, что фактически является переменной частотой дискретизации?tk=kTtk=kTt_k = …

55 fourier-analysis 

Я рассматриваю возможность изучения нового языка для использования в проектах численного / имитационного моделирования в качестве (частичной) замены для C ++ и Python, которые я сейчас использую. Я столкнулся с Джулией , которая звучит как-то идеально. Если он выполняет все свои требования, я мог бы использовать его для замены как …

55 parallel-computing  languages  julia 

Многие численные алгоритмы (интеграция, дифференцирование, интерполяция, специальные функции и т. Д.) Доступны в библиотеках научных вычислений, таких как GSL . Но я часто вижу код с «ручными» реализациями этих функций. Для небольших программ, которые не обязательно предназначены для публичного распространения, является ли обычной практикой среди специалистов по вычислительной технике самостоятельное …

54 libraries  c 

Каждый ученый должен знать немного о статистике: что означает корреляция, что такое доверительный интервал и так далее. Точно так же каждый ученый должен знать немного о компьютерах: вопрос в том, что? Что разумно ожидать, чтобы каждый работающий ученый знал о создании и использовании программного обеспечения? Наш список основных навыков - …

52 education 

Разреженные линейные системы появляются с возрастающей частотой в приложениях. Для решения этих систем нужно выбирать из множества процедур. На самом высоком уровне существует водораздел между прямым (например, разреженным методом исключения Гаусса или разложением Холецкого, со специальными алгоритмами упорядочения и мультифронтальными методами) и итерационным (например, GMRES, (би-) сопряженным градиентом) методами. Как …

49 linear-algebra  linear-solver  sparse-matrix 

Существует очевидная разница между конечной разностью и методом конечных объемов (переход от точечного определения уравнений к интегральным средним по ячейкам). Но я считаю, что FEM и FVM очень похожи; они оба используют интегральную форму и усредняют по клеткам. Что делает метод FEM, а не FVM? Я прочитал небольшую справочную информацию …

48 finite-element  finite-volume 

Я привык думать о конечных различиях как о частном случае конечных элементов в очень ограниченной сетке. Итак, каковы условия выбора между методом конечных разностей (FDM) и методом конечных элементов (FEM) в качестве численного метода? На стороне метода конечных разностей (FDM) можно считать, что они концептуально проще и проще в реализации, …

46 pde  finite-element 

Много раз, когда я унаследовал или столкнулся с научным кодом, написанным другими людьми (или, иногда, даже с моей собственной работой), я заметил, что документация либо недостаточна, либо вообще отсутствует. Если мне повезет, я вижу информативные комментарии. Если мне очень повезет, есть даже комментарии Doxygen и Doxyfile, так что у меня …

44 software  documentation