Вопросы с тегом «lme4-nlme»

Я пытаюсь вписать многомерную (то есть множественную реакцию) смешанную модель R. Помимо ASReml-rи SabreRпакетов (которые требуют внешнего программного обеспечения), то кажется , что это возможно только в MCMCglmm. В документе, который сопровождает MCMCglmmпакет (стр. 6), Джаррод Хэдфилд описывает процесс подгонки такой модели, например, преобразования нескольких переменных ответа в одну переменную …

10 r  mixed-model  multivariate-analysis  lme4-nlme  multivariate-regression 

Я только что (пере) читал книгу Гелмана « Почему нам (обычно) не нужно беспокоиться о множественных сравнениях» . В частности, в разделе «Множественные результаты и другие проблемы» упоминается использование иерархической модели для ситуаций, когда существует несколько связанных показателей одного и того же человека / подразделения в разное время / условия. …

10 multiple-comparisons  multilevel-analysis  lme4-nlme  jags  hierarchical-bayesian 

Структура данных > str(data) 'data.frame': 6138 obs. of 10 variables: $ RT : int 484 391 422 516 563 531 406 500 516 578 ... $ ASCORE : num 5.1 4 3.8 2.6 2.7 6.5 4.9 2.9 2.6 7.2 ... $ HSCORE : num 6 2.1 7.9 1 6.9 8.9 …

10 r  mixed-model  repeated-measures  model-selection  lme4-nlme 

Я хочу смоделировать две разные переменные времени, некоторые из которых сильно коллинеарны в моих данных (возраст + группа = период). Делая это, я столкнулся с некоторыми проблемами lmerи взаимодействиями poly(), но это, вероятно, не ограничивалось lmer, я получил те же результаты с nlmeIIRC. Очевидно, что мое понимание того, что делает …

10 r  lme4-nlme  polynomial 

Я заканчиваю анализ большого набора данных. Я хотел бы взять линейную модель, использованную в первой части работы, и переоснастить ее, используя линейную смешанную модель (LME). LME будет очень похожим, за исключением того, что одна из переменных, используемых в модели, будет использоваться в качестве случайного эффекта. Эти данные получены из многих …

10 r  regression  hypothesis-testing  mixed-model  lme4-nlme 

Это скорее концептуальный вопрос, но по мере использования Rя буду ссылаться на пакеты в R. Если цель состоит в том, чтобы подогнать линейную модель для целей прогнозирования, а затем делать прогнозы в тех случаях, когда случайные эффекты могут быть недоступны, есть ли польза от использования модели смешанных эффектов или вместо …

10 r  multiple-regression  mixed-model  lme4-nlme 

Я анализирую данные отслеживания глаз из разработанного эксперимента. Упрощенная версия моих данных выглядит следующим образом (Вы можете получить данные dput () здесь ), head(lookDATA) participant fixationImage fixationCount 1 9 Automobile 81 2 9 Bird 63 3 9 Chair 82 4 9 Dog 64 5 9 Face 90 6 9 Plant …

10 r  mixed-model  poisson-regression  lsmeans  lme4-nlme 

Я анализирую некоторые поведенческие данные, используя lme4in R, в основном следуя отличным учебникам Бодо Винтера , но не понимаю, правильно ли я обрабатываю взаимодействия. Хуже того, никто другой, участвующий в этом исследовании, не использует смешанные модели, поэтому я немного волнуюсь, чтобы убедиться, что все правильно. Вместо того, чтобы просто плакать …

10 r  mixed-model  p-value  lme4-nlme 

Какова структура дисперсии-ковариации по умолчанию для случайных эффектов в glmerили lmerв lme4пакете? Как определить другую дисперсионно-ковариационную структуру для случайных эффектов в коде? Я не мог найти информацию об этом в lme4документации.

10 mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

Я чувствую себя ошеломленным после того, как попытаюсь покопаться в литературе о том, как проводить анализ смешанной модели, следуя его примеру с использованием AIC, чтобы выбрать лучшую модель или модели. Я не думаю, что мои данные настолько сложны, но я ищу подтверждение того, что я сделал правильно, а затем советую, …

10 r  lme4-nlme  random-effects-model  aic 

вступление У меня есть участники, которые неоднократно касаются загрязненных поверхностей кишечной палочкой в ​​двух состояниях ( A = ношение перчаток, B = отсутствие перчаток). Я хочу знать, есть ли разница между количеством бактерий на кончиках пальцев в перчатках и без них, а также между количеством контактов. Оба фактора находятся внутри …

9 r  anova  repeated-measures  lme4-nlme  glmm 

Нередко случается, когда имеет дело со сложными максимальными смешанными моделями (оценка всех возможных случайных эффектов для данных и модели), это идеальная (+1 или -1) или почти идеальная корреляция между некоторыми случайными эффектами. В целях обсуждения давайте рассмотрим следующую модель и краткое изложение модели Model: Y ~ X*Cond + (X*Cond|subj) # …

9 r  correlation  mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

У меня есть несколько вопросов, касающихся спецификации и интерпретации GLMM. 3 вопроса, безусловно, являются статистическими, а 2 - более конкретно о R. Я пишу здесь, потому что, в конечном счете, я думаю, что проблема заключается в интерпретации результатов GLMM. В настоящее время я пытаюсь соответствовать GLMM. Я использую данные переписи …

9 r  lme4-nlme  poisson-distribution  negative-binomial  glmm 

Я подгоняю модель со смешанными эффектами сплайн-термином в приложении, где известно, что тренд во времени является криволинейным. Тем не менее, я хотел бы оценить, происходит ли криволинейный тренд из-за индивидуального отклонения от линейности, или это эффект на уровне группы, который делает подгонку уровня группы кажущейся криволинейной. Я привожу воспроизводимый пример, …

9 r  splines  lme4-nlme 

Я использую lmer в R, чтобы проверить влияние условия ( cond) на некоторый результат. Вот некоторые составные данные, где s - идентификатор субъекта a, bи c- условия. library("tidyr") library("dplyr") set.seed(123) temp <- data.frame(s = paste0("S", 1:30), a = rnorm(30, -2, 1), b = rnorm(30, -3, 1), c = rnorm(30, -4, …

9 r  lme4-nlme  contrasts