Вопросы с тегом «glmm»

Я пытаюсь понять, когда использовать случайный эффект, а когда он не нужен. Мне сказали, что эмпирическое правило, если у вас есть 4 или более групп / отдельных лиц, которые я делаю (15 отдельных лосей). Некоторые из этих лосей были эксперименты 2 или 3 раза в общей сложности 29 испытаний. Я …

34 mixed-model  lme4-nlme  random-effects-model  glmm 

Мне интересно, в чем различия между смешанными и несмешанными GLM. Например, в SPSS раскрывающееся меню позволяет пользователям выбрать: analyze-> generalized linear models-> generalized linear models & analyze-> mixed models-> generalized linear Они имеют дело с отсутствующими значениями по-другому? Моя зависимая переменная является двоичной, и у меня есть несколько категориальных и …

34 mixed-model  generalized-linear-model  glmm  gee 

В настоящее время я пытаюсь найти подходящую модель для сложных данных подсчета (зависимая переменная). Я пробовал различные модели (модели смешанных эффектов необходимы для моего вида данных), такие как lmerи lme4(с лог-преобразованием), а также обобщенные линейные модели смешанных эффектов с различными семействами, такими как гауссовский или отрицательный бином. Тем не менее, …

25 generalized-linear-model  residuals  negative-binomial  count-data  glmm 

Мы запустили логистическую регрессию со смешанными эффектами, используя следующий синтаксис; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Предмет и Предмет - случайные эффекты. Мы получаем странный результат: коэффициент и стандартное отклонение для предметного термина равны …

22 r  mixed-model  stata  glmm  lme4-nlme 

У меня есть эксперимент с повторными измерениями, где зависимая переменная представляет собой процент, и у меня есть несколько факторов в качестве независимых переменных. Я хотел бы использовать glmerиз пакета R, lme4чтобы рассматривать его как проблему логистической регрессии (путем указания family=binomial), так как он, кажется, приспосабливает эту настройку напрямую. Мои данные …

21 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

У меня есть GLMM с биномиальным распределением и функцией logit link, и у меня есть ощущение, что важный аспект данных недостаточно хорошо представлен в модели. Чтобы проверить это, я хотел бы знать, хорошо ли данные описываются линейной функцией на шкале логита. Следовательно, я хотел бы знать, хорошо ли ведут себя …

19 binomial  residuals  glmm  lme4-nlme 

Я использую glmerфункцию из lme4пакета в R, и я использую bobyqaоптимизатор (т.е. по умолчанию в моем случае). Я получаю предупреждение, и мне любопытно, что это значит. Warning message: In optwrap(optimizer, devfun, start, rho$lower, control = control, : convergence code 3 from bobyqa: bobyqa -- a trust region step failed to …

16 r  optimization  lme4-nlme  convergence  glmm 

Я пытаюсь использовать lme4::glmer()для подгонки биномиальной обобщенной смешанной модели (GLMM) с зависимой переменной, которая является не двоичной, а непрерывной переменной от нуля до единицы. Можно думать об этой переменной как о вероятности; на самом деле это вероятность того, как сообщили человеческих субъектов (в эксперименте , который я помочь анализирующего). Т.е. …

15 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

У меня есть набор данных, в котором переменная, которую я хотел бы использовать в качестве случайного эффекта, имеет только одно наблюдение для некоторых уровней. Основываясь на ответах на предыдущие вопросы, я понял, что в принципе это может быть хорошо. Могу ли я установить смешанную модель с объектами, которые имеют только …

14 r  mixed-model  generalized-linear-model  glmm  lme4-nlme 

Я использую модель логистической регрессии в форме: lmer(response~1+(1|site), family=binomial, REML = FALSE) Обычно я рассчитываю ICC на основе перехвата и остаточных отклонений, но сводка модели не включает остаточное отклонение. Как мне рассчитать это?

13 logistic  lme4-nlme  glmm 

Я столкнулся с рядом практических вопросов при моделировании данных подсчета из экспериментальных исследований с использованием эксперимента внутри объекта. Я кратко опишу эксперимент, данные и то, что я уже сделал, а затем мои вопросы. Четыре различных фильма были показаны выборке респондентов в последовательности. После каждого фильма проводилось интервью, в котором мы …

12 generalized-linear-model  negative-binomial  glmm  poisson-regression  overdispersion 

У меня есть следующая модель: > model1<-lmer(aph.remain~sMFS1+sAG1+sSHDI1+sbare+season+crop +(1|landscape),family=poisson) ... и это сводный результат. > summary(model1) Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation Formula: aph.remain ~ sMFS1 + sAG1 + sSHDI1 + sbare + season + crop + (1 | landscape) AIC BIC logLik deviance 4057 4088 -2019 4039 …

12 r  poisson-distribution  lme4-nlme  glmm  overdispersion 

При поиске любой информации о маргинальной модели и модели случайных эффектов и о том, как выбирать между ними, я нашел некоторую информацию, но это было более или менее математическое абстрактное объяснение (как, например, здесь: https: //stats.stackexchange .com / a / 68753/38080 ). Где-то я обнаружил, что наблюдаются существенные различия между …

11 mixed-model  random-effects-model  glmm  gee  marginal-model 

У меня случайная перехват логистической регрессии (из-за многократных измерений), и я хотел бы провести некоторую диагностику, особенно в отношении выбросов и влиятельных наблюдений. Я посмотрел на остатки, чтобы увидеть, есть ли наблюдения, которые выделяются. Но я также хотел бы взглянуть на что-то вроде расстояния Кука или DFFITS. Хосмер и Лемешоу …

11 mixed-model  outliers  glmm  cooks-distance 

Я надеюсь, что кто-то может помочь с тем, что я считаю относительно простым вопросом, и я думаю, что знаю ответ, но без подтверждения он стал тем, в чем я просто не могу быть уверен. У меня есть данные подсчета в качестве переменной ответа, и я хочу измерить, как эта переменная …

11 r  binomial  proportion  glmm  lme4-nlme