Вопросы с тегом «parallel-computing»

Я распараллеливаю код для численного решения пятимерной модели баланса населения. В настоящее время у меня есть очень хороший параллельный код MPICH2 в FORTRAN, но когда мы увеличиваем значения параметров, массивы становятся слишком большими, чтобы работать в режиме распределенной памяти. У меня есть доступ к кластеру с 15 узлами, где каждый …

14 parallel-computing  fortran  numerics  mpi  compiling 

При численном решении начальных краевых УОП очень распространено использование параллелизма в пространстве . Гораздо реже использовать некоторую форму параллелизма при дискретизации по времени , и этот параллелизм обычно гораздо более ограничен. Мне известно о растущем количестве кодов и опубликованных работ, демонстрирующих временный параллелизм, но ни один из них не включает …

14 pde  parallel-computing  time-integration 

Обычно я пишу последовательный код, а когда я делаю, я пишу модульные тесты с помощью некоторой среды тестирования в стиле xUnit (MATLAB xUnit, PyUnit / nose или среды тестирования Google C ++). Основываясь на беглом поиске в Google, я мало что видел в том, как практикующие юнит тестируют код, использующий …

13 parallel-computing  petsc  mpi  testing  reproducibility 

У меня есть коллекция вычислительных моделей, которые можно описать как асинхронные клеточные автоматы. Эти модели напоминают модель Изинга, но немного сложнее. Кажется, что такие модели выиграли бы от работы на GPU, а не на CPU. К сожалению, распараллелить такую ​​модель довольно непросто, и мне совершенно не понятно, как это сделать. …

12 parallel-computing  monte-carlo  gpu 

В настоящее время я разрабатываю метод декомпозиции области для решения задачи рассеяния. По сути, я решаю систему BVP Гельмгольца итеративно. Я дискретизирую уравнения, используя метод конечных элементов по треугольным или тетраэдрическим сеткам. Я разрабатываю код для моей кандидатской диссертации. Мне известны некоторые из существующих библиотек конечных элементов, такие как deal.ii …

11 finite-element  parallel-computing  mesh-generation  domain-decomposition  mesh 

Привет сообщество scicomp, Я работал в области графовых алгоритмов, используя такие фреймворки, как NetworkX (Python), JUNG и YFiles (Java). Сейчас я вхожу в область параллельных и высокопроизводительных вычислений. Для нового проекта я ищу библиотеку графов C ++ со следующими функциями: имеет интуитивно понятный интерфейс, который позволяет разработку алгоритма поддерживает динамические …

11 algorithms  parallel-computing  libraries  graph-theory 

У меня есть опыт кодирования OpenMP для машин с общей памятью (как на C, так и на FORTRAN) для выполнения простых задач, таких как сложение матриц, умножение и т. Д. (Просто чтобы посмотреть, как он конкурирует с LAPACK). Я достаточно знаю OpenMP, чтобы выполнять простые задачи, не обращаясь к документации. …

11 parallel-computing  python 

Насколько я понимаю, многосеточный метод решает линейную систему, решая более грубую версию той же проблемы (устраняя низкочастотную ошибку), затем проецируя обратно в точную сетку, чтобы сгладить высокочастотные ошибки. Для больших систем я вижу, как итерационный метод может быть реализован параллельно на каждом уровне сетки. Этот подход хорошо масштабируется параллельно? Есть …

11 linear-algebra  parallel-computing  multigrid 

Одновременно с моим исследованием методов подпространства Крылова у меня есть возможность исследовать математику за HPC на шаг впереди или теорию вычислений (аппаратные средства, ОС, компиляторы и т. Д.). В настоящее время я знаю и то, и другое, чтобы просто обойтись. Например, я знаю, как вывести уравнения для компьютерной графики и …

11 parallel-computing  education 

Алгоритмы Parareal, пита, и PFASST все поголовное-области техники для распараллеливания решения нестационарных задач во времени. Каковы руководящие принципы, лежащие в основе этих методов? Каковы основные различия между ними? Могу ли я сказать, что одно основано на другом? Как? Как насчет их приложений? Я знаю, что не будет ответа на вопрос …

10 parallel-computing  time-integration 

Я ищу портировать некоторый код, который разрешает систему уравнений в частных производных (PDE) методом конечных объемов в форме IMPLICIT (для дискретизации по времени). В результате существует трехдиагональная система уравнений в направлениях x, y, z, которая обрабатывается схемой ADI / TDMA. Я не могу найти что-то относительно неявного решения PDE с …

10 parallel-computing  implicit-methods  cuda 

В настоящее время я работаю над решением очень больших симметричных (но не положительно определенных) систем, порожденных некоторыми определенными алгоритмами. Эти матрицы имеют хороший разреженный блок, который можно использовать для параллельного решения. Но я не могу решить, должен ли я использовать прямой подход (например, мультифронтальный) или итеративный (предварительно подготовленный GMRES или …

10 parallel-computing  linear-solver  sparse-matrix  linear-system  gmres 

В последние годы появилось несколько библиотечно-программных проектов, которые предлагают ту или иную форму параллелизма общей памяти на основе данных общего назначения. Основная идея состоит в том, что вместо написания явно поточного кода программисты реализуют свои алгоритмы как взаимозависимые задачи, которые затем динамически распределяются промежуточным программным обеспечением общего назначения на машине …

10 parallel-computing  software  hpc  libraries  multicore 

Я очень новичок в программировании GPGPU, поэтому, пожалуйста, прости меня, если вопрос не особенно уместен. Из того, что я понимаю, программирование на GPU - очень сложная часть инженерной работы по сравнению с обычным программированием на CPU. Нужно быть очень осторожным в вопросах расхождения, тайлинга, распределенного распределения памяти и перекрытия связи …

10 parallel-computing  petsc  gpu  cuda 

Я пытаюсь диагонализировать некоторые плотные, плохо обусловленные матрицы. В машинной точности результаты являются неточными (возвращая отрицательные собственные значения, собственные векторы не имеют ожидаемой симметрии). Я переключился на функцию Eigensystem [] Mathematica, чтобы использовать преимущества произвольной точности, но вычисления очень медленные. Я открыт для любого количества решений. Существуют ли пакеты / …

10 linear-algebra  parallel-computing  eigensystem  precision  dense-matrix