Как построить эллипс из собственных значений и собственных векторов в R? [закрыто]


15

Может ли кто-нибудь придумать R- код для построения эллипса из собственных значений и собственных векторов следующей матрицы

Aзнак равно(2,20,40,42,8)

Ответы:


16

Вы можете извлечь собственные векторы и-значения через eigen(A). Однако проще использовать разложение Холецкого. Обратите внимание, что при построении доверительных эллипсов для данных оси эллипса обычно масштабируются, чтобы иметь длину = квадратный корень из соответствующих собственных значений, и это то, что дает разложение Холецкого.

ctr    <- c(0, 0)                               # data centroid -> colMeans(dataMatrix)
A      <- matrix(c(2.2, 0.4, 0.4, 2.8), nrow=2) # covariance matrix -> cov(dataMatrix)
RR     <- chol(A)                               # Cholesky decomposition
angles <- seq(0, 2*pi, length.out=200)          # angles for ellipse
ell    <- 1 * cbind(cos(angles), sin(angles)) %*% RR  # ellipse scaled with factor 1
ellCtr <- sweep(ell, 2, ctr, "+")               # center ellipse to the data centroid
plot(ellCtr, type="l", lwd=2, asp=1)            # plot ellipse
points(ctr[1], ctr[2], pch=4, lwd=2)            # plot data centroid

library(car)  # verify with car's ellipse() function
ellipse(c(0, 0), shape=A, radius=0.98, col="red", lty=2)

Изменить: чтобы построить собственные векторы, вы должны использовать более сложный подход. Это эквивалентно ответу Suncoolsu, он просто использует матричную нотацию для сокращения кода.

eigVal  <- eigen(A)$values
eigVec  <- eigen(A)$vectors
eigScl  <- eigVec %*% diag(sqrt(eigVal))  # scale eigenvectors to length = square-root
xMat    <- rbind(ctr[1] + eigScl[1, ], ctr[1] - eigScl[1, ])
yMat    <- rbind(ctr[2] + eigScl[2, ], ctr[2] - eigScl[2, ])
ellBase <- cbind(sqrt(eigVal[1])*cos(angles), sqrt(eigVal[2])*sin(angles)) # normal ellipse
ellRot  <- eigVec %*% t(ellBase)                                          # rotated ellipse
plot((ellRot+ctr)[1, ], (ellRot+ctr)[2, ], asp=1, type="l", lwd=2)
matlines(xMat, yMat, lty=1, lwd=2, col="green")
points(ctr[1], ctr[2], pch=4, col="red", lwd=3)

введите описание изображения здесь


Не могли бы вы нарисовать на этом эллипсе собственные значения и собственные векторы? Спасибо
MYaseen208

@ MYaseen208 Я отредактировал свой ответ, чтобы показать собственные векторы как оси эллипса. Половина длины осей равна корню квадратному из соответствующих собственных векторов.
Каракал,

7

Я думаю, что это код R, который вы хотите. Я позаимствовал R-код из этого темы в списке рассылки r. Идея в основном такова: главный и младший половинные диаметры - это два собственных значения, и вы поворачиваете эллипс на величину угла между первым собственным вектором и осью x

mat <- matrix(c(2.2, 0.4, 0.4, 2.8), 2, 2)
eigens <- eigen(mat)
evs <- sqrt(eigens$values)
evecs <- eigens$vectors

a <- evs[1]
b <- evs[2]
x0 <- 0
y0 <- 0
alpha <- atan(evecs[ , 1][2] / evecs[ , 1][1])
theta <- seq(0, 2 * pi, length=(1000))

x <- x0 + a * cos(theta) * cos(alpha) - b * sin(theta) * sin(alpha)
y <- y0 + a * cos(theta) * sin(alpha) + b * sin(theta) * cos(alpha)


png("graph.png")
plot(x, y, type = "l", main = expression("x = a cos " * theta * " + " * x[0] * " and y = b sin " * theta * " + " * y[0]), asp = 1)
arrows(0, 0, a * evecs[ , 1][2], a * evecs[ , 1][2])
arrows(0, 0, b * evecs[ , 2][3], b * evecs[ , 2][2])
dev.off()

введите описание изображения здесь


пожалуйста, не стесняйтесь меня поправлять. Я не думаю, что собственные векторы перпендикулярны (они должны быть теоретическими; может, я что-то замышляю?).
Suncoolsu

Aзнак равно(1-5-51)

Просто установите asp=1соотношение сторон 1 и перпендикулярные стрелки. Изменение вашего кода evs <- sqrt(eigens$values)дает тот же эллипс, что и мой ответ.
Каракал,

3
@ MYaseen208 Ваша новая матрица не является положительно определенной: она имеет отрицательные собственные значения и не является возможной ковариационной матрицей. Я не знаю, какой эллипс нарисовать в этом случае.
Каракал,

@ Каракал спасибо! ... да - я пропустил sqrt часть!
Suncoolsu
Используя наш сайт, вы подтверждаете, что прочитали и поняли нашу Политику в отношении файлов cookie и Политику конфиденциальности.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.