Фон
В статье Эпштейна (1991): При получении суточных климатологических значений из среднемесячных значений приводятся формулировка и алгоритм расчета интерполяции Фурье для периодических и равномерно распределенных значений.
В статье цель состоит в том, чтобы получить ежедневные значения из месячных средних значений путем интерполяции.
Короче говоря, предполагается, что неизвестные дневные значения могут быть представлены суммой гармонических компонентов: В статье (время) выражается в месяцах. t
После некоторого отклонения показано, что члены можно вычислить следующим образом:
Harzallah (1995) резюмирует этот подход следующим образом: «Интерполяция выполняется путем добавления нулей к спектральным коэффициентам данных и путем выполнения обратного преобразования Фурье к результирующим расширенным коэффициентам. Этот метод эквивалентен применению прямоугольного фильтра к коэффициентам Фурье «.
Вопросов
Моя цель - использовать вышеуказанную методологию для интерполяции еженедельных средних значений для получения ежедневных данных (см. Мой предыдущий вопрос ). Таким образом, у меня есть 835 еженедельных данных подсчета (см. Пример набора данных внизу вопроса). Есть довольно много вещей, которые я не понимаю, прежде чем я смогу применить подход, изложенный выше:
- Как изменить формулы для моей ситуации (еженедельно вместо месячных значений)?
- Как можно выразить время ? Я предположил, что (или с точками данных в целом), это правильно?т / 835 т / н н
- Почему автор вычисляет 7 членов (т. )? Сколько терминов я должен рассмотреть?
- Я понимаю, что вопрос, вероятно, можно решить с помощью регрессионного подхода и использования прогнозов для интерполяции (спасибо Нику). Тем не менее, некоторые вещи мне неясны: сколько терминов гармоник следует включить в регрессию? И какой период я должен взять? Как можно сделать регрессию, чтобы сохранить средние значения за неделю (поскольку я не хочу точного гармонического соответствия данных)?
Используя регрессионный подход (который также объясняется в этой статье ), мне удалось получить точную гармоническую подгонку к данным ( в моем примере будет проходить через , поэтому я установил 417 терминов). Как можно изменить этот подход - если возможно - чтобы добиться сохранения еженедельных средств? Может быть, применяя поправочные коэффициенты к каждому члену регрессии?1 , … , 417
График точной гармонической подгонки:
РЕДАКТИРОВАТЬ
Используя пакет сигналов и interp1
функцию, вот что мне удалось сделать, используя приведенный ниже пример данных (большое спасибо @noumenal). Я использую, q=7
поскольку у нас есть недельные данные:
# Set up the time scale
daily.ts <- seq(from=as.Date("1995-01-01"), to=as.Date("2010-12-31"), by="day")
# Set up data frame
ts.frame <- data.frame(daily.ts=daily.ts, wdayno=as.POSIXlt(daily.ts)$wday,
yearday = 1:5844,
no.influ.cases=NA)
# Add the data from the example dataset called "my.dat"
ts.frame$no.influ.cases[ts.frame$wdayno==3] <- my.dat$case
# Interpolation
case.interp1 <- interp1(x=ts.frame$yearday[!is.na(ts.frame$no.influ.case)],y=(ts.frame$no.influ.cases[!is.na(ts.frame$no.influ.case)]),xi=ts.frame$yearday, method = c("cubic"))
# Plot subset for better interpretation
par(bg="white", cex=1.2, las=1)
plot((ts.frame$no.influ.cases)~ts.frame$yearday, pch=20,
col=grey(0.4),
cex=1, las=1,xlim=c(0,400), xlab="Day", ylab="Influenza cases")
lines(case.interp1, col="steelblue", lwd=1)
Здесь есть две проблемы:
- Кривая кажется «слишком хорошей»: она проходит через каждую точку
- Еженедельные средства не сохраняются
Пример набора данных
structure(list(date = structure(c(9134, 9141, 9148, 9155, 9162,
9169, 9176, 9183, 9190, 9197, 9204, 9211, 9218, 9225, 9232, 9239,
9246, 9253, 9260, 9267, 9274, 9281, 9288, 9295, 9302, 9309, 9316,
9323, 9330, 9337, 9344, 9351, 9358, 9365, 9372, 9379, 9386, 9393,
9400, 9407, 9414, 9421, 9428, 9435, 9442, 9449, 9456, 9463, 9470,
9477, 9484, 9491, 9498, 9505, 9512, 9519, 9526, 9533, 9540, 9547,
9554, 9561, 9568, 9575, 9582, 9589, 9596, 9603, 9610, 9617, 9624,
9631, 9638, 9645, 9652, 9659, 9666, 9673, 9680, 9687, 9694, 9701,
9708, 9715, 9722, 9729, 9736, 9743, 9750, 9757, 9764, 9771, 9778,
9785, 9792, 9799, 9806, 9813, 9820, 9827, 9834, 9841, 9848, 9855,
9862, 9869, 9876, 9883, 9890, 9897, 9904, 9911, 9918, 9925, 9932,
9939, 9946, 9953, 9960, 9967, 9974, 9981, 9988, 9995, 10002,
10009, 10016, 10023, 10030, 10037, 10044, 10051, 10058, 10065,
10072, 10079, 10086, 10093, 10100, 10107, 10114, 10121, 10128,
10135, 10142, 10149, 10156, 10163, 10170, 10177, 10184, 10191,
10198, 10205, 10212, 10219, 10226, 10233, 10240, 10247, 10254,
10261, 10268, 10275, 10282, 10289, 10296, 10303, 10310, 10317,
10324, 10331, 10338, 10345, 10352, 10359, 10366, 10373, 10380,
10387, 10394, 10401, 10408, 10415, 10422, 10429, 10436, 10443,
10450, 10457, 10464, 10471, 10478, 10485, 10492, 10499, 10506,
10513, 10520, 10527, 10534, 10541, 10548, 10555, 10562, 10569,
10576, 10583, 10590, 10597, 10604, 10611, 10618, 10625, 10632,
10639, 10646, 10653, 10660, 10667, 10674, 10681, 10688, 10695,
10702, 10709, 10716, 10723, 10730, 10737, 10744, 10751, 10758,
10765, 10772, 10779, 10786, 10793, 10800, 10807, 10814, 10821,
10828, 10835, 10842, 10849, 10856, 10863, 10870, 10877, 10884,
10891, 10898, 10905, 10912, 10919, 10926, 10933, 10940, 10947,
10954, 10961, 10968, 10975, 10982, 10989, 10996, 11003, 11010,
11017, 11024, 11031, 11038, 11045, 11052, 11059, 11066, 11073,
11080, 11087, 11094, 11101, 11108, 11115, 11122, 11129, 11136,
11143, 11150, 11157, 11164, 11171, 11178, 11185, 11192, 11199,
11206, 11213, 11220, 11227, 11234, 11241, 11248, 11255, 11262,
11269, 11276, 11283, 11290, 11297, 11304, 11311, 11318, 11325,
11332, 11339, 11346, 11353, 11360, 11367, 11374, 11381, 11388,
11395, 11402, 11409, 11416, 11423, 11430, 11437, 11444, 11451,
11458, 11465, 11472, 11479, 11486, 11493, 11500, 11507, 11514,
11521, 11528, 11535, 11542, 11549, 11556, 11563, 11570, 11577,
11584, 11591, 11598, 11605, 11612, 11619, 11626, 11633, 11640,
11647, 11654, 11661, 11668, 11675, 11682, 11689, 11696, 11703,
11710, 11717, 11724, 11731, 11738, 11745, 11752, 11759, 11766,
11773, 11780, 11787, 11794, 11801, 11808, 11815, 11822, 11829,
11836, 11843, 11850, 11857, 11864, 11871, 11878, 11885, 11892,
11899, 11906, 11913, 11920, 11927, 11934, 11941, 11948, 11955,
11962, 11969, 11976, 11983, 11990, 11997, 12004, 12011, 12018,
12025, 12032, 12039, 12046, 12053, 12060, 12067, 12074, 12081,
12088, 12095, 12102, 12109, 12116, 12123, 12130, 12137, 12144,
12151, 12158, 12165, 12172, 12179, 12186, 12193, 12200, 12207,
12214, 12221, 12228, 12235, 12242, 12249, 12256, 12263, 12270,
12277, 12284, 12291, 12298, 12305, 12312, 12319, 12326, 12333,
12340, 12347, 12354, 12361, 12368, 12375, 12382, 12389, 12396,
12403, 12410, 12417, 12424, 12431, 12438, 12445, 12452, 12459,
12466, 12473, 12480, 12487, 12494, 12501, 12508, 12515, 12522,
12529, 12536, 12543, 12550, 12557, 12564, 12571, 12578, 12585,
12592, 12599, 12606, 12613, 12620, 12627, 12634, 12641, 12648,
12655, 12662, 12669, 12676, 12683, 12690, 12697, 12704, 12711,
12718, 12725, 12732, 12739, 12746, 12753, 12760, 12767, 12774,
12781, 12788, 12795, 12802, 12809, 12816, 12823, 12830, 12837,
12844, 12851, 12858, 12865, 12872, 12879, 12886, 12893, 12900,
12907, 12914, 12921, 12928, 12935, 12942, 12949, 12956, 12963,
12970, 12977, 12984, 12991, 12998, 13005, 13012, 13019, 13026,
13033, 13040, 13047, 13054, 13061, 13068, 13075, 13082, 13089,
13096, 13103, 13110, 13117, 13124, 13131, 13138, 13145, 13152,
13159, 13166, 13173, 13180, 13187, 13194, 13201, 13208, 13215,
13222, 13229, 13236, 13243, 13250, 13257, 13264, 13271, 13278,
13285, 13292, 13299, 13306, 13313, 13320, 13327, 13334, 13341,
13348, 13355, 13362, 13369, 13376, 13383, 13390, 13397, 13404,
13411, 13418, 13425, 13432, 13439, 13446, 13453, 13460, 13467,
13474, 13481, 13488, 13495, 13502, 13509, 13516, 13523, 13530,
13537, 13544, 13551, 13558, 13565, 13572, 13579, 13586, 13593,
13600, 13607, 13614, 13621, 13628, 13635, 13642, 13649, 13656,
13663, 13670, 13677, 13684, 13691, 13698, 13705, 13712, 13719,
13726, 13733, 13740, 13747, 13754, 13761, 13768, 13775, 13782,
13789, 13796, 13803, 13810, 13817, 13824, 13831, 13838, 13845,
13852, 13859, 13866, 13873, 13880, 13887, 13894, 13901, 13908,
13915, 13922, 13929, 13936, 13943, 13950, 13957, 13964, 13971,
13978, 13985, 13992, 13999, 14006, 14013, 14020, 14027, 14034,
14041, 14048, 14055, 14062, 14069, 14076, 14083, 14090, 14097,
14104, 14111, 14118, 14125, 14132, 14139, 14146, 14153, 14160,
14167, 14174, 14181, 14188, 14195, 14202, 14209, 14216, 14223,
14230, 14237, 14244, 14251, 14258, 14265, 14272, 14279, 14286,
14293, 14300, 14307, 14314, 14321, 14328, 14335, 14342, 14349,
14356, 14363, 14370, 14377, 14384, 14391, 14398, 14405, 14412,
14419, 14426, 14433, 14440, 14447, 14454, 14461, 14468, 14475,
14482, 14489, 14496, 14503, 14510, 14517, 14524, 14531, 14538,
14545, 14552, 14559, 14566, 14573, 14580, 14587, 14594, 14601,
14608, 14615, 14622, 14629, 14636, 14643, 14650, 14657, 14664,
14671, 14678, 14685, 14692, 14699, 14706, 14713, 14720, 14727,
14734, 14741, 14748, 14755, 14762, 14769, 14776, 14783, 14790,
14797, 14804, 14811, 14818, 14825, 14832, 14839, 14846, 14853,
14860, 14867, 14874, 14881, 14888, 14895, 14902, 14909, 14916,
14923, 14930, 14937, 14944, 14951, 14958, 14965, 14972), class = "Date"),
cases = c(168L, 199L, 214L, 230L, 267L, 373L, 387L, 443L,
579L, 821L, 1229L, 1014L, 831L, 648L, 257L, 203L, 137L, 78L,
82L, 69L, 45L, 51L, 45L, 63L, 55L, 54L, 52L, 27L, 24L, 12L,
10L, 22L, 42L, 32L, 52L, 82L, 95L, 91L, 104L, 143L, 114L,
100L, 83L, 113L, 145L, 175L, 222L, 258L, 384L, 755L, 976L,
879L, 846L, 1004L, 801L, 799L, 680L, 530L, 410L, 302L, 288L,
234L, 269L, 245L, 240L, 176L, 188L, 128L, 96L, 59L, 63L,
44L, 52L, 39L, 50L, 36L, 40L, 48L, 32L, 39L, 28L, 29L, 16L,
20L, 25L, 25L, 48L, 57L, 76L, 117L, 107L, 91L, 90L, 83L,
76L, 86L, 104L, 101L, 116L, 120L, 185L, 290L, 537L, 485L,
561L, 1142L, 1213L, 1235L, 1085L, 1052L, 987L, 918L, 746L,
620L, 396L, 280L, 214L, 148L, 148L, 94L, 107L, 69L, 55L,
69L, 47L, 43L, 49L, 30L, 42L, 51L, 41L, 39L, 40L, 38L, 22L,
37L, 26L, 40L, 56L, 54L, 74L, 99L, 114L, 114L, 120L, 114L,
123L, 131L, 170L, 147L, 163L, 163L, 160L, 158L, 163L, 124L,
115L, 176L, 171L, 214L, 320L, 507L, 902L, 1190L, 1272L, 1282L,
1146L, 896L, 597L, 434L, 216L, 141L, 101L, 86L, 65L, 55L,
35L, 49L, 29L, 55L, 53L, 57L, 34L, 43L, 42L, 13L, 17L, 20L,
27L, 36L, 47L, 64L, 77L, 82L, 82L, 95L, 107L, 96L, 106L,
93L, 114L, 102L, 116L, 128L, 123L, 212L, 203L, 165L, 267L,
550L, 761L, 998L, 1308L, 1613L, 1704L, 1669L, 1296L, 975L,
600L, 337L, 259L, 145L, 91L, 70L, 79L, 63L, 58L, 51L, 53L,
39L, 49L, 33L, 47L, 56L, 32L, 43L, 47L, 19L, 32L, 18L, 34L,
39L, 63L, 57L, 55L, 69L, 76L, 103L, 99L, 108L, 131L, 113L,
106L, 122L, 138L, 136L, 175L, 207L, 324L, 499L, 985L, 1674L,
1753L, 1419L, 1105L, 821L, 466L, 274L, 180L, 143L, 82L, 101L,
72L, 55L, 71L, 50L, 33L, 26L, 25L, 27L, 21L, 24L, 24L, 20L,
18L, 18L, 25L, 23L, 13L, 10L, 16L, 9L, 12L, 16L, 25L, 31L,
36L, 40L, 36L, 47L, 32L, 46L, 75L, 63L, 49L, 90L, 83L, 101L,
78L, 79L, 98L, 131L, 83L, 122L, 179L, 334L, 544L, 656L, 718L,
570L, 323L, 220L, 194L, 125L, 95L, 77L, 46L, 42L, 29L, 35L,
21L, 29L, 16L, 14L, 19L, 15L, 19L, 18L, 21L, 10L, 14L, 7L,
7L, 5L, 9L, 14L, 11L, 18L, 22L, 39L, 36L, 46L, 44L, 37L,
30L, 39L, 37L, 45L, 71L, 59L, 57L, 80L, 68L, 88L, 72L, 74L,
208L, 357L, 621L, 839L, 964L, 835L, 735L, 651L, 400L, 292L,
198L, 85L, 64L, 41L, 40L, 23L, 18L, 14L, 22L, 9L, 19L, 8L,
14L, 12L, 15L, 14L, 4L, 6L, 7L, 7L, 8L, 13L, 10L, 19L, 17L,
20L, 22L, 40L, 37L, 45L, 34L, 26L, 35L, 67L, 49L, 77L, 82L,
80L, 104L, 88L, 49L, 73L, 113L, 142L, 152L, 206L, 293L, 513L,
657L, 919L, 930L, 793L, 603L, 323L, 202L, 112L, 55L, 31L,
27L, 15L, 15L, 6L, 13L, 21L, 10L, 11L, 9L, 8L, 11L, 7L, 5L,
1L, 4L, 7L, 2L, 6L, 12L, 14L, 21L, 29L, 32L, 26L, 22L, 44L,
39L, 47L, 44L, 93L, 145L, 289L, 456L, 685L, 548L, 687L, 773L,
575L, 355L, 248L, 179L, 129L, 122L, 103L, 72L, 72L, 36L,
26L, 31L, 12L, 14L, 14L, 14L, 7L, 8L, 2L, 7L, 8L, 9L, 26L,
10L, 13L, 13L, 5L, 5L, 3L, 6L, 1L, 10L, 6L, 7L, 17L, 12L,
21L, 32L, 29L, 18L, 22L, 24L, 38L, 52L, 53L, 73L, 49L, 52L,
70L, 77L, 95L, 135L, 163L, 303L, 473L, 823L, 1126L, 1052L,
794L, 459L, 314L, 252L, 111L, 55L, 35L, 14L, 30L, 21L, 16L,
9L, 11L, 6L, 6L, 8L, 9L, 9L, 10L, 15L, 15L, 11L, 6L, 3L,
8L, 4L, 7L, 7L, 13L, 10L, 23L, 24L, 36L, 25L, 34L, 37L, 46L,
39L, 37L, 55L, 65L, 54L, 60L, 82L, 55L, 53L, 61L, 52L, 75L,
92L, 121L, 170L, 199L, 231L, 259L, 331L, 357L, 262L, 154L,
77L, 34L, 41L, 21L, 17L, 16L, 7L, 15L, 11L, 7L, 5L, 6L, 13L,
7L, 6L, 8L, 7L, 1L, 11L, 9L, 3L, 9L, 9L, 8L, 15L, 19L, 16L,
10L, 12L, 26L, 35L, 35L, 41L, 34L, 30L, 36L, 43L, 23L, 55L,
107L, 141L, 217L, 381L, 736L, 782L, 663L, 398L, 182L, 137L,
79L, 28L, 26L, 16L, 14L, 8L, 4L, 4L, 6L, 6L, 11L, 4L, 5L,
7L, 7L, 6L, 8L, 2L, 3L, 3L, 1L, 1L, 3L, 3L, 2L, 8L, 8L, 11L,
10L, 11L, 8L, 24L, 25L, 25L, 33L, 36L, 51L, 61L, 74L, 92L,
89L, 123L, 402L, 602L, 524L, 494L, 406L, 344L, 329L, 225L,
136L, 136L, 84L, 55L, 55L, 42L, 19L, 28L, 8L, 7L, 2L, 7L,
6L, 4L, 3L, 5L, 3L, 3L, 0L, 1L, 2L, 3L, 2L, 1L, 2L, 2L, 9L,
4L, 9L, 10L, 18L, 15L, 13L, 12L, 10L, 19L, 15L, 22L, 23L,
34L, 43L, 53L, 47L, 57L, 328L, 552L, 787L, 736L, 578L, 374L,
228L, 161L, 121L, 96L, 58L, 50L, 37L, 14L, 9L, 6L, 15L, 12L,
9L, 1L, 6L, 4L, 7L, 7L, 3L, 6L, 9L, 15L, 22L, 28L, 34L, 62L,
54L, 75L, 65L, 58L, 57L, 60L, 37L, 47L, 60L, 89L, 90L, 193L,
364L, 553L, 543L, 676L, 550L, 403L, 252L, 140L, 125L, 99L,
63L, 63L, 76L, 85L, 68L, 67L, 38L, 25L, 24L, 11L, 9L, 9L,
4L, 8L, 4L, 6L, 5L, 2L, 6L, 4L, 4L, 1L, 5L, 4L, 1L, 2L, 2L,
2L, 2L, 3L, 4L, 4L, 7L, 5L, 2L, 10L, 11L, 17L, 11L, 16L,
15L, 11L, 12L, 21L, 20L, 25L, 46L, 51L, 90L, 123L)), .Names = c("date",
"cases"), row.names = c(NA, -835L), class = "data.frame")