Вопросы с тегом «mpi»

Хотите улучшить этот пост? Предоставьте подробные ответы на этот вопрос, включая цитаты и объяснение того, почему ваш ответ правильный. Ответы без достаточной детализации могут быть отредактированы или удалены. Версия стандарта MPI 3.0 формально удалила интерфейс C ++ (ранее он был устаревшим). Хотя реализации все еще могут поддерживать его, новые функции …

28 c++  mpi 

У меня есть приложение, которое можно тривиально распараллелить, но его производительность в значительной степени связана с вводом / выводом. Приложение считывает один входной массив, хранящийся в файле, размер которого обычно составляет 2-5 ГБ (но я ожидаю, что это число будет расти в будущем). Типичные вычисления применяют одну и ту же …

20 io  parallel-computing  mpi 

Больше всего в MPI мне не нравится иметь дело с типами данных (то есть картами данных / масками), потому что они не очень хорошо подходят для объектно-ориентированного C ++. boost::mpiоднако поддерживает только MPI 1.1 со своего веб-сайта: boost :: mpi - это дружественный к C ++ интерфейс стандартного интерфейса передачи …

16 hpc  c++  mpi 

Я распараллеливаю код для численного решения пятимерной модели баланса населения. В настоящее время у меня есть очень хороший параллельный код MPICH2 в FORTRAN, но когда мы увеличиваем значения параметров, массивы становятся слишком большими, чтобы работать в режиме распределенной памяти. У меня есть доступ к кластеру с 15 узлами, где каждый …

14 parallel-computing  fortran  numerics  mpi  compiling 

Обычно я пишу последовательный код, а когда я делаю, я пишу модульные тесты с помощью некоторой среды тестирования в стиле xUnit (MATLAB xUnit, PyUnit / nose или среды тестирования Google C ++). Основываясь на беглом поиске в Google, я мало что видел в том, как практикующие юнит тестируют код, использующий …

13 parallel-computing  petsc  mpi  testing  reproducibility 

Я работаю над проблемой, которую можно распараллелить, используя одну операцию mpi_allgather или одну операцию mpi_scatter и одну операцию mpi_gather. Эти операции вызываются в цикле while, поэтому их можно вызывать много раз. В реализации со схемой MPI_allgather я собираю распределенный вектор по всем процессам для решения дубликатов матриц. В другой реализации …

11 algorithms  complexity  mpi 

Я пытаюсь оптимизировать приложение MPI с высоко асинхронным шаблоном связи. Каждый ранг имеет список вещей для вычисления и отправляет сообщения по мере необходимости, если входы или выходы находятся на другом ранге. Кроме того, каждый ранг является многопоточным (в настоящее время с одним коммуникационным потоком и 5 рабочими). Я снабдил код …

10 mpi  visualization 

Я ищу заслуживающие доверия ссылки на то, сколько ресурсов суперкомпьютеры тратят на координацию, а не на выполнение реальной работы, связанной с задачами. Ресурсы могут иметь доступную вычислительную мощность, но даже ватты кажутся действительными единицами. Я полагаю, что один из моих профессоров или учебников однажды сказал, что в массивно параллельных системах …

10 hpc  mpi