Как читать добро подходят по NLS R?


12

Я пытаюсь интерпретировать вывод nls (). Я прочитал этот пост, но я все еще не понимаю, как выбрать наиболее подходящий. Из моих припадок у меня есть два выхода:

> summary(m)

  Formula: y ~ I(a * x^b)

  Parameters:
  Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
  a 479.92903   62.96371   7.622 0.000618 ***
  b   0.27553    0.04534   6.077 0.001744 ** 
  ---
  Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

  Residual standard error: 120.1 on 5 degrees of freedom

  Number of iterations to convergence: 10 
  Achieved convergence tolerance: 6.315e-06 

и

> summary(m1)

  Formula: y ~ I(a * log(x))

  Parameters:
  Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
  a   384.49      50.29   7.645 0.000261 ***
  ---
  Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

  Residual standard error: 297.4 on 6 degrees of freedom

  Number of iterations to convergence: 1 
  Achieved convergence tolerance: 1.280e-11

Первый имеет два параметра и меньшую остаточную ошибку. Второй только один параметр, но худшая остаточная ошибка. Какой лучше всего подходит?


4
Икс

3
Я удалил свой ответ, в котором предлагалось использовать AIC, потому что комментарий убедительно доказывал, что AIC, как правило, не подходит для выбора nlsподгонок. Я бы всегда пытался выбрать нелинейную модель, основанную на механистических знаниях, особенно если набор данных такой же маленький, как и у вас.
Роланд

1
Хммм. Будет ли оригинальный комментатор удаленного ответа @ Roland готов опубликовать комментарий? Для меня не сразу очевидно, почему AIC не подходит ... (хотя stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2010-August/250742.html дает некоторые подсказки) - и в заключение, если вы пытаясь определить трансформацию власти, вы можете попробовать трансформации Бокса-Кокса ( boxcoxв MASSкомплекте)
Бен Болкер,

1
AIC может быть использован для выбора моделей.

Ответы:


2

Вы можете просто использовать тест F и anova, чтобы сравнить их. Вот несколько кодов.

> x <- 1:10
> y <- 2*x + 3                            
> yeps <- y + rnorm(length(y), sd = 0.01)
> 
> 
> m1=nls(yeps ~ a + b*x, start = list(a = 0.12345, b = 0.54321))
> summary(m1)

Formula: yeps ~ a + b * x

Parameters:
   Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
a 2.9965562  0.0052838   567.1   <2e-16 ***
b 2.0016282  0.0008516  2350.6   <2e-16 ***
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

Residual standard error: 0.007735 on 8 degrees of freedom

Number of iterations to convergence: 2 
Achieved convergence tolerance: 3.386e-09 

> 
> 
> m2=nls(yeps ~ a + b*x+c*I(x^5), start = list(a = 0.12345, b = 0.54321,c=10))
> summary(m2)

Formula: yeps ~ a + b * x + c * I(x^5)

Parameters:
   Estimate Std. Error  t value Pr(>|t|)    
a 3.003e+00  5.820e-03  516.010   <2e-16 ***
b 1.999e+00  1.364e-03 1466.004   <2e-16 ***
c 2.332e-07  1.236e-07    1.886    0.101    
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

Residual standard error: 0.006733 on 7 degrees of freedom

Number of iterations to convergence: 2 
Achieved convergence tolerance: 1.300e-06 

> 
> anova(m1,m2)
Analysis of Variance Table

Model 1: yeps ~ a + b * x
Model 2: yeps ~ a + b * x + c * I(x^5)
  Res.Df Res.Sum Sq Df     Sum Sq F value Pr(>F)
1      8 0.00047860                             
2      7 0.00031735  1 0.00016124  3.5567 0.1013
>

5
Больше информации о том, как интерпретировать результаты?
Скан

Пожалуйста, расширьте. С моим набором данных я не получаю вывод для значения F и для Pr (> F). Какой смысл проводить анализ на анову? Я только знаком с тем, что он используется для сравнения категорий, а не моделей.
user3386170
Используя наш сайт, вы подтверждаете, что прочитали и поняли нашу Политику в отношении файлов cookie и Политику конфиденциальности.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.