Существует ли пакет R (или даже базовая функция R), который реализует метод Фишера или Стоуффера для объединения p-значений? Кодирование этого должно быть почти тривиальным, но я бы предпочел использовать (и процитировать) пакет.
Пример кода в этом вопросе: метод Фишера для комбинирования p-значений - как насчет нижнего хвоста?
Ответы:
metapПакет Майкла Дьюи реализует множество способов объединения р-значения:
sumlog: Метод Фишераsumz: Похоже на метод Стоуффера (с весами), это явно не упоминается в документации функции, но подтверждается в черновой виньетке (которая пока не входит в пакет)meanp: При объединении p-значений, почему бы не просто усреднить?В пакете также есть combine.testфункция (на Биокондукторе). Реализует метод Фишера и Стоуффера, а также метод logit.survcomp
survcompтакже работает в крайнем случае одного значения, обрабатывает пропущенные значения более согласованно с базой r и поощряет вклады путем предоставления официального репо.