Вопросы с тегом «computational-biology»

Мой опыт в области геномики, но я недавно работал над проблемами, связанными со структурой белка. Я написал несколько соответствующих программ на C, создавая собственный анализатор PDB-файлов с самого начала. Я не беспокоился о создании действительно надежного синтаксического анализатора, я просто знал, что его создание будет лучшим способом заставить себя по-настоящему …

17 computational-biology  pdb  c 

Я довольно много работаю в области математической биологии / эпидемиологии, где в большинстве работ по моделированию / вычислительной науке все еще преобладают наборы ODE, правда, иногда довольно сложные их наборы. Одним из плюсов этих моделей является то, что их довольно легко описать и воспроизвести. Таблица значений параметров, а также сами …

14 ode  computational-biology 

Я пытался создать биологически точную двухмерную пространственную модель слоев ткани, где бывают разные физиологические процессы. Это включает главным образом химические реакции, диффузию и потоки через границы. Я делаю эту модель в COMSOL Multiphysics, программном пакете с конечными элементами, который решает различные физические задачи, такие как системы реакции-диффузии, хотя для моего …

10 finite-element  comsol  computational-biology 

У меня есть система обыкновенных дифференциальных уравнений - 7 уравнений и ~ 30 параметров, управляющих их поведением, как часть математической модели передачи болезни. Я бы хотел , чтобы найти устойчивые состояния для этих уравнений Changing dx/dt = rest of the equationдля 0 = equationкаждого из уравнений делает простую проблему алгебры. …

9 ode  symbolic-computation  computational-biology