Я хотел бы выгрузить пакет без необходимости перезапуска R (в основном потому, что перезапуск R, когда я пробую разные, конфликтующие пакеты, вызывает разочарование, но, возможно, это можно использовать в программе, чтобы использовать одну функцию, а затем другую - хотя пространство имен ссылки, вероятно, лучшая идея для этого использования).

?library не показывает никаких опций, которые могли бы выгрузить пакет.

Существует предложение, которое detachможет выгрузить пакет, но следующие оба не удаются:

detach(vegan)

Ошибка в detach(vegan): неверный nameаргумент

detach("vegan")

Ошибка в detach("vegan"): неверный nameаргумент

Так как же выгрузить пакет?

Попробуйте это (см. ?detachДля более подробной информации):

detach("package:vegan", unload=TRUE)

Можно одновременно загрузить несколько версий пакета (например, если у вас есть версия для разработки и стабильная версия в разных библиотеках). Чтобы гарантировать, что все копии отделены, используйте эту функцию.

detach_package <- function(pkg, character.only = FALSE)
{
  if(!character.only)
  {
    pkg <- deparse(substitute(pkg))
  }
  search_item <- paste("package", pkg, sep = ":")
  while(search_item %in% search())
  {
    detach(search_item, unload = TRUE, character.only = TRUE)
  }
}

Использование, например

detach_package(vegan)

или

detach_package("vegan", TRUE)

Вы также можете использовать unloadNamespaceкоманду, как в:

unloadNamespace("sqldf")

Функция отсоединяет пространство имен перед его выгрузкой.

Вы можете снять флажок с кнопки в RStudio (пакеты).

Я попробовал то, что Кохске написал в качестве ответа, и снова получил ошибку, поэтому я провел некоторый поиск и обнаружил, что это работает для меня (R 3.0.2):

require(splines) # package
detach(package:splines)

или также

library(splines)
pkg <- "package:splines"
detach(pkg, character.only = TRUE)

Когда вы собираетесь туда и обратно между сценариями он может только иногда необходимо выгрузить пакет. Вот простой оператор IF, который предотвратит появление предупреждений, если вы попытаетесь выгрузить пакет, который еще не был загружен.

if("package:vegan" %in% search()) detach("package:vegan", unload=TRUE) 

Включение этого в начало сценария может быть полезным.

Я надеюсь, что это делает ваш день!

detach(package:PackageName) работает и нет необходимости использовать кавычки.

Вы можете попробовать все, что хотите, чтобы удалить пакет (и все зависимости, которые он ввел вместе с ним), unloadNamespace()но объем памяти все равно останется. И нет,detach("package:,packageName", unload=TRUE, force = TRUE) работать тоже не будет.

Из новой консоли или Session > Restart Rпроверьте память с помощью pryrпакета:

pryr::mem_used()

# 40.6 MB   ## This will depend on which packages are loaded obviously (can also fluctuate a bit after the decimal)

Проверь мой sessionInfo()

R version 3.6.1 (2019-07-05)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 17763)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_Canada.1252  LC_CTYPE=English_Canada.1252    LC_MONETARY=English_Canada.1252 LC_NUMERIC=C                   
[5] LC_TIME=English_Canada.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.6.1   pryr_0.1.4       magrittr_1.5     tools_3.6.1      Rcpp_1.0.3       stringi_1.4.3    codetools_0.2-16 stringr_1.4.0   
[9] packrat_0.5.0   

Давайте загрузим Seuratпакет и проверим новый объем памяти :

library(Seurat)
pryr::mem_used()

# 172 MB    ## Likely to change in the future but just to give you an idea

Давайте использовать, unloadNamespace()чтобы удалить все:

unloadNamespace("Seurat")
unloadNamespace("ape")
unloadNamespace("cluster")
unloadNamespace("cowplot")
unloadNamespace("ROCR")
unloadNamespace("gplots")
unloadNamespace("caTools")
unloadNamespace("bitops")
unloadNamespace("fitdistrplus")
unloadNamespace("RColorBrewer")
unloadNamespace("sctransform")
unloadNamespace("future.apply")
unloadNamespace("future")
unloadNamespace("plotly")
unloadNamespace("ggrepel")
unloadNamespace("ggridges")
unloadNamespace("ggplot2")
unloadNamespace("gridExtra")
unloadNamespace("gtable")
unloadNamespace("uwot")
unloadNamespace("irlba")
unloadNamespace("leiden")
unloadNamespace("reticulate")
unloadNamespace("rsvd")
unloadNamespace("survival")
unloadNamespace("Matrix")
unloadNamespace("nlme")
unloadNamespace("lmtest")
unloadNamespace("zoo")
unloadNamespace("metap")
unloadNamespace("lattice")
unloadNamespace("grid")
unloadNamespace("httr")
unloadNamespace("ica")
unloadNamespace("igraph")
unloadNamespace("irlba")
unloadNamespace("KernSmooth")
unloadNamespace("leiden")
unloadNamespace("MASS")
unloadNamespace("pbapply")
unloadNamespace("plotly")
unloadNamespace("png")
unloadNamespace("RANN")
unloadNamespace("RcppAnnoy")
unloadNamespace("tidyr")
unloadNamespace("dplyr")
unloadNamespace("tibble")
unloadNamespace("RANN")
unloadNamespace("tidyselect")
unloadNamespace("purrr")
unloadNamespace("htmlwidgets")
unloadNamespace("htmltools")
unloadNamespace("lifecycle")
unloadNamespace("pillar")
unloadNamespace("vctrs")
unloadNamespace("rlang")
unloadNamespace("Rtsne")
unloadNamespace("SDMTools")
unloadNamespace("Rdpack")
unloadNamespace("bibtex")
unloadNamespace("tsne")
unloadNamespace("backports")
unloadNamespace("R6")
unloadNamespace("lazyeval")
unloadNamespace("scales")
unloadNamespace("munsell")
unloadNamespace("colorspace")
unloadNamespace("npsurv")
unloadNamespace("compiler")
unloadNamespace("digest")
unloadNamespace("R.utils")
unloadNamespace("pkgconfig")
unloadNamespace("gbRd")
unloadNamespace("parallel")
unloadNamespace("gdata")
unloadNamespace("listenv")
unloadNamespace("crayon")
unloadNamespace("splines")
unloadNamespace("zeallot")
unloadNamespace("reshape")
unloadNamespace("glue")
unloadNamespace("lsei")
unloadNamespace("RcppParallel")
unloadNamespace("data.table")
unloadNamespace("viridisLite")
unloadNamespace("globals")

Теперь проверьте sessionInfo():

R version 3.6.1 (2019-07-05)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 17763)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_Canada.1252  LC_CTYPE=English_Canada.1252    LC_MONETARY=English_Canada.1252 LC_NUMERIC=C                   
[5] LC_TIME=English_Canada.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] tools_3.6.1       stringr_1.4.0     rstudioapi_0.10   pryr_0.1.4        jsonlite_1.6      gtools_3.8.1      R.oo_1.22.0      
 [8] magrittr_1.5      Rcpp_1.0.3        R.methodsS3_1.7.1 stringi_1.4.3     plyr_1.8.4        reshape2_1.4.3    codetools_0.2-16 
[15] packrat_0.5.0     assertthat_0.2.1 

Проверьте объем памяти :

pryr::mem_used()

# 173 MB

Ссылка на демонстрацию ролей

Я хотел бы добавить альтернативное решение. Это решение не дает прямого ответа на ваш вопрос о выгрузке пакета, но, IMHO, предоставляет более чистую альтернативу для достижения желаемой цели, которая, как я понимаю, в целом связана с предотвращением конфликтов имен и пробой различных функций, как указано:

в основном потому, что перезапуск R, когда я пробую разные, конфликтующие пакеты, вызывает разочарование, но, возможно, это можно использовать в программе для использования одной функции, а затем другой - хотя ссылки на пространство имен, вероятно, являются лучшей идеей для такого использования

Решение

Функция, with_packageпредлагаемая через withrпакет, дает возможность:

прикрепить пакет к пути поиска, выполнить код, а затем удалить пакет из пути поиска. Однако пространство имен пакета не выгружается.

пример

library(withr)
with_package("ggplot2", {
  ggplot(mtcars) + geom_point(aes(wt, hp))
})
# Calling geom_point outside withr context 
exists("geom_point")
# [1] FALSE

geom_pointиспользуемый в примере недоступен из глобального пространства имен. Я считаю, что это может быть более чистый способ обработки конфликтов, чем загрузка и выгрузка пакетов.

Обратите внимание, что вы можете использовать только unload()один раз. Если вы используете его второй раз без повторного library()запуска, вы получите не очень информативное сообщение об ошибке, недопустимый аргумент 'name' :

library(vegan)
#> Loading required package: permute
#> Loading required package: lattice
#> This is vegan 2.5-6
detach("package:vegan",  unload=TRUE)
detach("package:vegan",  unload=TRUE)
#> Error in detach("package:vegan", unload = TRUE): invalid 'name' argument

^{Создано 2020-05-09 пакетом представлением (v0.3.0)}

Просто перейдите в окно OUTPUT, затем щелкните значок Packages (он расположен между иконками Plot и Help ). Удалите « галочку / галочку » из пакета, который вы хотите выгрузить.

Для повторного использования пакета просто поставьте « галочку или галочку » перед пакетом или используйте:

library (lme4)

Другой вариант

devtools::unload("your-package")

Это , по- видимому , также имеет дело с вопросом о зарегистрированных методов S3, которые не удаляются сunloadNamespace()