Ошибка в plot.new (): слишком большие поля рисунка в R

Я новичок в R, но я сделал множество графиков корреляции с меньшими наборами данных. Однако, когда я пытаюсь построить большой набор данных (2 ГБ +), я могу построить график просто отлично, но легенда не отображается. Любой совет? или альтернативы?

library(gplots)
r.cor <- cor(r)
layout(matrix(c(1,1,1,1,1,1,1,1,2,2), 5, 2, byrow = TRUE))
par(oma=c(5,7,1,1))
cx <- rev(colorpanel(25,"yellow","black","blue"))
leg <- seq(min(r.cor,na.rm=T),max(r.cor,na.rm=T),length=10)
image(r.cor,main="Correlation plot Normal/Tumor data",axes=F,col=cx)
axis(1, at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]], 
    cex.axis=0.9,las=2)
axis(2,at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]],
     cex.axis=0.9,las=2)
image(as.matrix(leg),col=cx,axes=T)     

Ошибка plot.new(): слишком большие поля рисунка

tmp <- round(leg,2)
axis(1,at=seq(0,1,length=length(leg)), labels=tmp,cex.axis=1)

Я подозреваю, что проблема в том, что область 2 маленькой фигуры, созданная вашим layout()вызовом, недостаточно велика, чтобы содержать только поля по умолчанию, не говоря уже о графике.

Перед строкой, вызывающей проблему, попробуйте:

par(mar = rep(2, 4))

затем постройте второе изображение

image(as.matrix(leg),col=cx,axes=T)

Вам нужно будет поиграть с размером полей на par()вызове, который я показываю, чтобы понять это правильно. Вам также может потребоваться увеличить размер фактического устройства, на котором вы строите.

Последний совет: сохраните par()настройки по умолчанию перед их изменением, поэтому измените существующий par()вызов на:

op <- par(oma=c(5,7,1,1))

затем в конце построения сделайте

par(op)

Эта ошибка может возникать в Rstudio просто потому, что ваша панель «Графики» слишком мала. Попробуйте увеличить ваши «Файлы, графики, пакеты, справку, средство просмотра» и посмотрите, поможет ли это!

Если вы получили это сообщение в RStudio, щелкните фигуру «метла» «Очистить все графики» на вкладке «Графики» и снова попробуйте plot ().

Иногда такое случается в RStudio. Чтобы решить эту проблему, вы можете попытаться построить график во внешнем окне (только для Windows):

windows() ## create window to plot your file
## ... your plotting code here ...
dev.off() 

Я получил эту ошибку в R Studio, и ее просто исправили, увеличив боковую панель, щелкнув и перетащив ее край справа налево.

Проверьте, является ли ваш объект списком или вектором. Для этого наберите is.list(yourobject). Если это правда, попробуйте переименовать его x<-unlist(yourobject). Это превратит его в вектор, который вы можете построить.

Просто увеличьте эту область, если вы используете RStudio.

Я обнаружил эту ошибку сегодня. Изначально я пытался вывести его в .jpegфайл с малой шириной и высотой.

jpeg("method1_test.jpg", width=900, height=900, res=40)

Позже я увеличил ширину и высоту до:

jpeg("method1_test.jpg", width=1900, height=1900, res=40)

Ошибки не было. :)

Вы также можете поиграть с разрешением, если разрешение высокое, вам нужно больше ширины и высоты.

У меня была эта ошибка, когда я пытался построить многомерные данные. Если это то, что с вами происходит, попробуйте многомерное масштабирование: http://www.statmethods.net/advstats/mds.html

Я боролся с этой ошибкой в ​​течение нескольких недель (используя RStudio). Я пытался перемещать окно графика все больше и меньше, но это не всегда помогало. Когда я переместил (перетащил) приложение на свой больший монитор, проблема исчезла! Я был ошеломлен ... столько потраченных впустую часов ... Я знал, что мой код правильный ...

Холст RStudio Plots ограничивает ширину и высоту графика. Однако, если вы сделаете свой график из фрагмента кода Rmarkdown , он будет работать без ограничения поля холста, поскольку область рисования устанавливается в соответствии с размером бумаги.

Например:

    ```{r}
#inside of code chunk in Rmarkdown
        grid <- par(mfrow=c(4, 5))
        plot(faithful, main="Faithful eruptions")
        plot(large.islands, main="Islands", ylab="Area")
        ...
        par(grid)
    ```

Сегодня я обнаружил ту же ошибку. Я попробовал кнопку «Очистить все графики», но у меня возникла та же ошибка. Тогда у меня сработал этот трюк, попробуйте увеличить площадь графика перетаскиванием. Это вам точно поможет.

Я просто использовал Очистить все графики, а затем снова дал команду графика, и это было полезно

Если маржа низкая, всегда лучше начинать с нового плоттера:

dev.new()
# plot()
# save your plot
dev.off()

Вы никогда не получите маржинальной погрешности, если только вы не нанесете на карту что-то большое, что не может быть размещено.