Встроенная сеть Unity - это RakNet. Насколько я знаю, в Unity это действительно только для одноранговых игр (то есть вы не можете запустить автономный сервер).
Большинство известных мне веб-игр используют Unity, а многопользовательские игры используют Photon из Exit Games . Paradise Paintball использует это. Атмосфир тоже. Вы пишете серверный код в .NET, который компилируется в DLL и запускается с их серверным программным обеспечением. Есть клиентская DLL, которую вы можете просто вставить в Unity вместе со своим собственным конкретным кодом.
Вы не можете распространять сервер, поскольку он лицензируется для каждого компьютера, на котором вы работаете, но если вы просто хотите, чтобы клиенты могли подключаться к вашим серверам, то это проверенное решение для этого.