Просто чтобы быть абсолютно ясным, Integer Factorization, как известно, не является NP-промежуточным звеном, просто предполагается, что он основан на отсутствии либо NP-полноты, либо алгоритма за полиномиальное время (несмотря на большую работу, вложенную в оба). Я не знаю ни одной естественной проблемы (т.е. не построенной Ладнером для доказательства), которая определенно является NP-промежуточной, если P и NP разные.
Хорошо, после этого отказа от ответственности граф Изоморфизм является еще одним вероятным кандидатом на естественную NP-промежуточную проблему. Существует простое сокращение полиномиального времени от него до изоморфизма подграфа - просто оставьте графики одинаковыми! Изоморфизм графов - это частный случай изоморфизма подграфов, когда оба графа имеют одинаковый размер. Последним штрихом является то , что подграф Изоморфизм является NP-полной.
Кроме того, всегда есть не столь информативное сокращение, обещанное теоремой Кука-Левина , мы знаем, что любая NP-промежуточная задача имеет некоторую недетерминированную машину Тьюринга за полиномиальное время, которая ее решает, и мы можем преобразовать ее в экземпляр SAT (просто нужно построить ТМ!).