Вы можете использовать, rpm -qf /bin/ls
чтобы выяснить, к какому пакету принадлежит ваша установленная версия:
[09:46:58] ~ $ rpm -qf /bin/ls
coreutils-8.5-7.fc14.i686
[09:47:01] ~ $
Обновление: согласно вашему комментарию, должно работать следующее, если вы хотите только имя пакета (я только что получил возможность протестировать):
[01:52:49] ~ $ rpm -qf /bin/ls --queryformat '%{NAME}\n'
coreutils
[01:52:52] ~ $
Вы также можете использовать dnf provides /bin/ls
для получения списка всех доступных пакетов репозитория, которые будут предоставлять файл:
# dnf provides /bin/ls
Last metadata expiration check: 0:17:06 ago on Tue Jun 27 18:04:08 2017.
coreutils-8.25-17.fc25.x86_64 : A set of basic GNU tools commonly used in shell scripts
Repo : @System
coreutils-8.25-17.fc25.x86_64 : A set of basic GNU tools commonly used in shell scripts
Repo : updates
coreutils-8.25-14.fc25.x86_64 : A set of basic GNU tools commonly used in shell scripts
Repo : fedora