Ответы:
Простой пример: создание сжатого архива из каталога, исключая подкаталог и перечисляющий содержимое:
$ ls fruit/
apple banana peach tomato
$ tar czf onlyfruit.tar.gz --exclude=tomato fruit/
$ tar tf onlyfruit.tar.gz
fruit/
fruit/peach/
fruit/apple/
fruit/banana/
использовать --exclude=directory
флаг. Работает как шарм.