Super_Lявляется ключом X Tmux работает в терминале. Это ваш эмулятор терминала, чтобы преобразовать KeySym в последовательность символов. Таким образом, вам придется настроить как эмулятор терминала, так и tmux.
В документации по tmux префиксом может быть только известное имя ключа с необязательным модификатором. Таким образом, вы можете установить префикс tmux на комбинацию клавиш, например, которую вы не используете M-F12, и заставить свой терминал отправлять последовательность символов, M-F12когда вы нажимаете Super_L. Приложив немного больше работы, вы можете использовать клавишу, которой, вероятно, нет на клавиатуре (tmux принимает F13в F20качестве имен клавиш, но они должны быть объявлены в terminfo).
На стороне эмулятора терминала вам нужно будет Super_Lсгенерировать последовательность клавиш \e\e[24~(для M-F12) или \e[34~(для F20) (где \eнаходится escape-символ). Как это сделать, зависит от эмулятора терминала (а некоторые недостаточно настраиваются для этого). С помощью xterm это делается через ресурсы X:
! Make Super_L act as Meta+F12
XTerm.VT100.translations: #override \
<Key>Super_L: string("\033\033[24~")
Вы можете попасть в зацепку, которая Super_Lобычно является модификатором, и клавиши-модификаторы не всегда работают, когда не требуется модификатор. Если вы не хотите Super_Lбыть модификатором, вы можете убрать его модификатор или (менее запутанно) использовать другой ключ для симуляции физического ключа. Это можно сделать с помощью xmodmap (старомодный и простой для понимания), xkb (современный, плохо документированный, мощный и сложный способ) или, возможно, с помощью инструмента конфигурации графического интерфейса вашей рабочей среды.