Ответы:
Команда сделать это изнутри Emacs
M-x server-mode
При первом запуске он перезапустит сервер, на котором работает. Во второй раз это остановит сервер.
Чтобы убедиться, что вы останавливаете сервер, передайте аргумент неположительного префикса: M-0 M-x server-mode RET