Как запустить параллельные процессы и объединить результаты, когда оба закончили

У меня есть скрипт оболочки bash, в котором я передаю некоторые данные через 5 или 6 различных программ, а затем окончательные результаты в файл с разделителями табуляции.

Затем я делаю то же самое снова для отдельного подобного набора данных и выводлю во второй файл.

Затем оба файла вводятся в другую программу для сравнительного анализа. например, чтобы упростить

Data1 | this | that |theother | grep |sed | awk |whatever > Data1Res.csv
Data2 | this | that |theother | grep |sed | awk |whatever > Data2Res.csv
AnalysisProg -i Data1res.csv Data2res.csv

Мой вопрос: как я могу сделать шаги 1 и 2 запущенными одновременно (например, с помощью &), но запускать только шаг 3 (AnalysisProg), когда оба завершены?

Спасибо

ps AnalysisProg не будет работать в потоке или fifo.

Использование wait. Например:

Data1 ... > Data1Res.csv &
Data2 ... > Data2Res.csv &
wait
AnalysisProg

будет:

• запустить каналы Data1 и Data2 в качестве фоновых заданий
• ждать, пока они оба закончат
• запустите AnalysisProg.

Смотрите, например, этот вопрос .

Ответ cxw, без сомнения, является предпочтительным решением, если у вас есть только 2 файла. Если эти 2 файла являются просто примерами, а у вас в действительности есть 10000 файлов, то решение «&» не будет работать, так как это приведет к перегрузке вашего сервера. Для этого вам понадобится такой инструмент, как GNU Parallel:

ls Data* | parallel 'cat {} | this | that |theother | grep |sed | awk |whatever > {}res.csv
AnalysisProg -i *res.csv

Чтобы узнать больше о GNU Parallel:

• Посмотрите вступительное видео для быстрого ознакомления: https://www.youtube.com/playlist?list=PL284C9FF2488BC6D1
• Пройдите учебник (man parallel_tutorial). Ваша командная строка будет любить вас за это.

Один из способов сделать это может выглядеть примерно так:

AnalysisProg <<PREPROCESS /dev/stdin
$( 
{   process1=$( pipe | line | 1 >&2 & echo $! )
    process2=$( pipe | line | 2 >&2 & echo $! )
    while ps -p $process1 $process2 >/dev/null; do
        sleep 1
    done
} 2>&1
)
#END
PREPROCESS

Таким образом, вы создаете фоновый режим для обоих конвейеров, но все еще ждете, пока они завершат выполнение, прежде чем объединить их вывод в стандартный ввод, который оценивается в данном документе и передается AnalysisProg. Если вы можете использовать waitэто, то это даже лучше, чем while psцикл, но, в зависимости от оболочки, waitможет возражать, если вы дадите ему команду ждать процесса, который не является потомком текущей оболочки.

Также обратите внимание, что вышеуказанный метод будет сопоставлять выходные данные - поэтому оба процесса будут записывать данные одновременно. Если вы хотите вместо этого разделить их или добавить друг к другу, возможно, вы можете сделать следующее:

AnalysisProg 3<<PREPROCESS /dev/fd/3 /dev/stderr
$(
process1=$(... >&2 ...) 2>/dev/fd/3
...
} 3>/dev/fd/3 2>/dev/stderr
)

Я продемонстрировал эти концепции раньше. Наверное, лучшие демо здесь и здесь .

Попробуйте использовать это.

rm -f Data1Res.csv
rm -f Data2Res.csv
Data1 | this | that |theother | grep |sed | awk |whatever > Data1Res.csv &
Data2 | this | that |theother | grep |sed | awk |whatever > Data2Res.csv &
while true
do
  ps aux | grep -v grep | grep -i -E 'Data1Res.csv|Data2Res.csv' &> /dev/null
  if [ $? -ne 0 ]
  then
    AnalysisProg -i Data1res.csv Data2res.csv
    exit 0
  fi
done