Запустив Ubuntu 14.04 LTS, я смог воспроизвести вашу проблему, используя как unity-control-center(менеджер по умолчанию «Системные настройки» для Ubuntu), так и mate-display-properties(который реализует «Предпочтения монитора» для альтернативы рабочего стола MATE). Если вы просто поверните дисплеи, это не позволит вам просто перетянуть их ближе друг к другу - похоже, это ошибка, может быть, эта .
Я смог обойти эту проблему, просто немного повозившись (после установки желаемой ориентации). Вот последовательность, которая, кажется, работает (учитывая мое конкретное начальное расположение):
- Перетащите дисплей 3, чтобы сесть ниже, и по диагонали, чтобы отобразить 1.
- Перетащите дисплей 2, чтобы он находился рядом с дисплеем 1.
- Перетащите дисплей 3, чтобы он находился рядом с дисплеем 2.
Это похоже на какую-то скользящую головоломку , где вы не можете перейти непосредственно от начала и до конца, а вместо этого должны переходить через промежуточные «легальные» состояния.
Ниже приведен скриншот после первого шага.

РЕДАКТИРОВАТЬ: 3+ года спустя я больше не могу воспроизвести исправление, которое я разместил здесь. В MATE-версии инструмента явно есть ошибка .
ARandR хорош по нескольким причинам:
- Он не страдает от ошибки вращения (он знает правильную геометрию для каждого дисплея).
- У него нет функции привязки, поэтому вы можете разместить дисплеи там, где вы хотите.
- Это позволяет вам сохранять макеты в виде сценариев оболочки - давая вам быстрый способ восстановить предыдущие состояния