В Ubuntu 12.04 или 14.04 с Unity следующее может нарушить вашу конфигурацию Apt.
В системе -> настройки -> сетевой прокси, включите автоматическую настройку прокси> и введите URL-адрес PAC.
Затем нажмите «Применить всю систему», и это должно помочь.
Проблема в том, что Apt не имеет понятия «no_proxy» и пытается отправить весь трафик через этот прокси. Есть несколько способов обойти это, один из них - создать специальный файл переопределения, чтобы Apt сказал ему использовать / игнорировать прокси. Взято из /superuser/323488/ubuntu-system-wide-proxy-auto-configuration-pac-script
Acquire {
Retries "0";
HTTP {
Proxy "";
};
};
Другой вариант - после нажатия кнопки «Применить» на странице «Сетевой прокси» перейдите к редактированию файла /etc/apt/apt.conf как root sudo gedit /etc/apt/apt.conf
и удалите все упоминания прокси в этом файле.