В этом случае вы должны использовать одинарные '
или двойные кавычки "
вокруг URL (и вообще):
wget 'http://www.flareget.com/files/flareget/debs/amd64/flareget_2.3-24_amd64(stable)_deb.tar.gz'
Отныне вы должны использовать этот метод в целом, когда вы используете строку, которая содержит круглые скобки в качестве аргумента в команде. Это связано с тем, что круглые скобки используются для группировки оболочкой таким образом, что они никак не передаются команде. Итак, оболочка bash выдаст вам синтаксическую ошибку:
$ echo some (parentheses)
bash: syntax error near unexpected token `('
$ echo 'some (parentheses)'
some (parentheses)
mypass="'HWNevtQW9o2s)f'"
unzip -P $mypass myfile