После установки библиотеки geos (C ++ и C), а затем попытки установить пакет rgeos (R), он сообщает об отсутствии geos-config!


9

Зная, что пакет rgeos от языка R требует предварительной установки библиотек geos, я установил libgeos и libgeos-c1 (3.2.2), используя установщик synaptic на моем компьютере с Ubuntu 12.04 (32-битной).

Затем я попытался установить rgeos непосредственно с консоли R, и он выдал сообщение в том смысле, что geos-config не был найден. Вывод следующий:

> install.packages("rgeos")
Installing package(s) into ‘/home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15’
(as ‘lib’ is unspecified)
also installing the dependency ‘sp’

probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/sp_1.0-9.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 882102 bytes (861 Kb)
URL abierta
==================================================
downloaded 861 Kb

probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/rgeos_0.2-19.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 221471 bytes (216 Kb)
URL abierta
==================================================
downloaded 216 Kb

* installing *source* package ‘sp’ ...
** package ‘sp’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c R    centroid.c -o Rcentroid.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c gcdist.c -o gcdist.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c init.c -o init.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c pip.c -o pip.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c pip2.c -o pip2.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c sp_xports.c -o sp_xports.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c surfaceArea.c -o surfaceArea.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c zerodist.c -o zerodist.o
gcc -std=gnu99 -shared -o sp.so Rcentroid.o gcdist.o init.o pip.o pip2.o sp_xports.o surfaceArea.o zerodist.o -L/usr/lib/R/lib -lR
installing to /home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15/sp/libs
** R
** data
** demo
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
   ‘intro_sp.Rnw’ 
   ‘over.Rnw’ 
** testing if installed package can be loaded

* DONE (sp)
* installing *source* package ‘rgeos’ ...
** package ‘rgeos’ successfully unpacked and MD5 sums checked
configure: CC: gcc -std=gnu99
configure: CXX: g++
configure: rgeos: 0.2-17
checking for /usr/bin/svnversion... no
configure: svn revision: 394
checking geos-config usability... 
./configure: line 1385: geos-config: command not found
no
configure: error: geos-config not usable
ERROR: configuration failed for package ‘rgeos’
* removing ‘/home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15/rgeos’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘rgeos’ had non-zero exit status

Простите мое невежество, но я не знаю, откуда этот файл, "geos-config", происходит: должен ли он генерироваться компиляциями gcc, описанными выше, или он должен быть предварительно установлен, когда были установлены библиотеки libgeos?

На другом компьютере я узнал, что «geos-config» является исполняемым файлом и его следует установить в / usr / bin.

У вас есть идеи, что не так с моей процедурой?

Спасибо,

-Sergio.

Ответы:


14

Установите пакет libgeos-devУстановите libgeos-dev с вашим любимым менеджером пакетов (или центром программного обеспечения), и вы получите /usr/bin/geos-config.

Как я нашел это? Я использовал запрос geos-configдля файлов на веб-странице http://packages.ubuntu.com/ . Это перечислит пакет, который вам нужен ( ссылка на запрос ). Используйте это в следующий раз, когда вы столкнетесь с подобными проблемами!


2
Вы также можете использовать хороший инструмент apt-fileдля поиска файлов в репозитории Ubuntu. Например. apt-file search geos-configдаст вам точное соответствие libgeos-dev.
ortang

Спасибо! Я сделал так, как вы рекомендовали, и пакет R "rgeos" также был установлен без проблем.
JulioSergio

2

Поскольку OP не называет конкретный дистрибутив, вот строка, которая мне понадобилась для установки Go-Config на CENTOS (например, RHEL & Amazon Linux): yum install -y geos-devel

Используя наш сайт, вы подтверждаете, что прочитали и поняли нашу Политику в отношении файлов cookie и Политику конфиденциальности.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.