Ответы:
На данный момент нет простого способа сделать это.
В настоящее время существует открытый отчет об ошибке по этой проблеме: https://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=599453
В то же время, я бы порекомендовал перейти на xchat или irssi, которые являются отличными программами для чата (xchat - это GUI, а irssi - это CLI), и в них гораздо меньше ошибок, чем сочувствия. (если вы не хотите испытывать / отлаживать / расширять эмпатию)
Я мог бы предложить, что вы можете очистить разговор. Это не мешает иметь эти сообщения, но может вручную удалить его.