Я искал этот вопрос и пока не получил разумного ответа. Если я синхронизирую папку, будет ли она синхронизировать символическую ссылку? Будет ли он обрабатываться по ссылке на все файлы в этой символической ссылке?

Из Ubuntu One FAQ :

Поддерживает ли Ubuntu One символические или жесткие ссылки?

Нет, Ubuntu One в настоящее время не поддерживает символические или жесткие ссылки. Если вы используете Ubuntu 10.04 LTS или выше, вы можете синхронизировать папки в вашем домашнем каталоге, щелкнув по ним правой кнопкой мыши и выбрав «Синхронизировать в Ubuntu One».

Обходной путь: Вы можете создать жесткую ссылку в другой папке; затем переместите эту вновь созданную жесткую ссылку в папку Ubuntu One. Я попробовал это в терминале, и это сработало, так что я думаю, вы также можете написать скрипт и использовать его как скрипт наутилуса.