Если я правильно понимаю вопрос, вы хотели бы иметь возможность переключать рабочие пространства независимо для каждого экрана, чтобы, например, левый экран мог находиться в рабочей области 1, а правый - в рабочей области 3. Это поддерживается некоторыми оконными менеджерами, большинство особенно XMonad , и я лично нахожу это чрезвычайно удобным в установке с двумя головками. Более того, вполне возможно интегрировать XMonad с GNOME, не жертвуя удобством использования.
На моем домашнем компьютере у меня в настоящее время намного более простая установка с оконным менеджером по умолчанию. Мне нравится, когда музыкальный проигрыватель постоянно отображается на одном из экранов, поэтому я просто прикрепил проигрыватель к видимому рабочему месту, чтобы эмулировать «отдельное рабочее пространство». Это на самом деле не решает проблему, но может быть полезно в любом случае.