Получил ту же эргономическую проблему!
Ctrl+ Dили Добавить закладку будет работать только в том случае, если в строке адреса выбран «требуемый каталог ссылок». «Закладки» появятся только на Местах (Наутилус) после размещения одной закладки. Не очень дружелюбная ИМО ...
Ссылки: «Добавление закладки
Чтобы добавить закладку, откройте папку или местоположение, которое хотите добавить в закладки, затем выберите «Места» -> «Добавить закладку».
Если вы используете окно браузера Nautilus, выберите Закладки-> Добавить закладку. "From: http://linux.about.com/library/gnome/blgnome6n6p.htm
И
http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=2027355
И, наконец, справка от Ubuntu: Руководство по Ubuntu Desktop »Файлы› Советы и вопросы »Редактирование закладок папки
Это почти дублируется из:
закладки Nautilus не появляются вообще
?