Я знаю, что это старая Q, но все еще актуальна, плюс Google привел меня сюда (другие придут).
Принятый ответ является частично правильным, по умолчанию вы не можете устанавливать права на выполнение в разделе NTFS или FAT (по крайней мере, для Ubuntu и до даты).
Но вы можете изменить это , изменив способ монтирования вашего NTFS-раздела. То есть (выбор и) настройка драйвера ntfs, который монтирует ваши разделы.
NTFS поддерживает все необходимые вам разрешения *, но драйвер должен знать, как с ними обращаться, чтобы он не мешал другим ОС.
Это не ракетостроение, но заставит вас понять вещи, которые вас не волнуют!
Смотрите этот (очень краткий) ответ на связанный вопрос:
/ubuntu//a/74851/239919
* Поддерживает владение и чтение / запись / выполнение для пользователя и группы, не знаю о setuid или stickybit.