В обычных обстоятельствах шенгенская заявка не заботится о вашей канадской визе; потому что вы просто подаете заявление на туристическую визу в шенгенскую зону на три месяца.
Тем не менее, я полагаю, что вы планируете предоставить маршрут для вашей шенгенской визы, который показывает, что вы проживаете в Брюсселе в течение 3 месяцев, а затем отправляетесь в Канаду; и в этом случае вы должны иметь действующую визу для Канады до подачи заявления.
Если вы хотите избежать этого, вы можете отправить маршрут, который покажет, что вы возвращаетесь в Индию, получить шенгенскую визу, а затем подать заявление на получение канадской визы.
Затем вы можете настроить свой маршрут, чтобы вылететь в Канаду из Брюсселя. После выдачи визы не имеет значения, откуда вы отправляетесь в Канаду.