Внешние накопители (или внутренние - тот же накопитель, другой корпус) не будут иметь проблем с коммерческими авиаперевозками. Рентген не влияет на них, и любые вибрации в полете, способные повредить дисковод, также разрушат самолет.
Теперь это при условии, что он выключен. Работающие диски не любят, когда их вырывают, но это относится и к вашему столу. Как уже упоминалось, высота является фактором, влияющим на вращающиеся приводы, но пределы высоты значительно превышают стандартное давление в кабине. Если желтые маски выскочат из-под потолка, пришло время убрать компьютер, так как вы очень скоро приземлитесь.
Поэтому, если вы не уроните его вниз по лестнице, или он не упадет с багажной тележки и не столкнется с самолетом, все будет хорошо.