У меня была похожая проблема. Для меня я не мог chmod символическую ссылку, даже как root независимо от того, как я вызвал chmod. Чтобы запутать это, nautilus показывал владельца / группу как ничего. Владелец был просто пустым. Поэтому я попытался изменить символическую ссылку, используя nautilus, работающий от имени пользователя root, поскольку chmod не работал и nautilus аварийно завершил работу !!
Но я думаю, что понял проблему. Каталог, на который указывала символическая ссылка, имел другие права доступа, чем символическая ссылка. Поэтому я изменил целевой каталог (используя -h) на имя пользователя / группы. Затем chmod'ed символическую ссылку на то же самое, и это сработало! И просмотр информации о символической ссылке в nautilus (с правами root) теперь больше не дает сбоя.
Так что для других, имеющих подобную проблему, проверьте разрешения целевого каталога / файла и убедитесь, что он совместим с разрешениями, для которых вы устанавливаете символическую ссылку.