Вы должны попробовать rsync, чтобы отслеживать скорость передачи. Например:
rsync -PSauv sourcedir/* destdir/
Если вы действительно видите снижение скорости передачи, в отличие от файлов, которые просто большие, то вам нужно взглянуть на несколько других вещей.
Если ваш диск связан с вводом / выводом, у вас будут проблемы. Это часто наблюдается при интенсивной записи на флэш-диск или внешнее USB-устройство.
Проверьте оба диска, hdparm -Tt <device>
чтобы убедиться, что один из них значительно медленнее, чем должен быть, или значительно медленнее, чем другое устройство, что может привести к проблемам ввода-вывода.
Проверьте вывод dmesg и состояние SMART, чтобы убедиться в отсутствии явных ошибок на диске. Вы также можете подумать,
badblocks -n
если вы подозреваете ошибки диска на диске не SMART.
Существует множество причин, по которым диск может работать с перебоями или работать неоптимально, но пока вы не сможете измерить проблему, вы не узнаете, в чем проблема. :)