Ответы:
Вы не можете скопировать их, но вы можете создавать ссылки в Windows. Другая операционная система, вероятно, не распознает их как ссылки, поэтому, если вы попытаетесь скопировать, вы можете получить две одинаковые папки.
[ РЕДАКТИРОВАТЬ по крайней мере в некоторых версиях NTFS для Linux символические ссылки, созданные под windows, также являются символическими ссылками под Linux Это работает из коробки с Ubuntu Oeneric, который, кажется, использует драйвер FUSE]