Ответы:
~/Library/Preferences/com.googlecode.iterm2.plist
К сожалению, создание символической ссылки недостаточно, поскольку библиотека Apple стирает ее при сохранении настроек. Думаю, это можно сделать с помощью cron и умного скрипта.
Последние версии iTerm2 поддерживают явную настройку расположения файла настроек, который вы можете вставить в ~/DropBox/Apps/com.googlecode.iterm2.plist
и это, кажется, работает нормально. Предпочтение iTerm2 находится на вкладке «Общие».