Ответы:
Руководство пользователя гласит:
Пауза приостановит выбранные торрент-задания, но не остановит их. Это говорит µTorrent о попытке сохранить соединения с одноранговыми узлами без необходимости их повторного установления, как того требует запуск остановленных торрент-заданий. Это полезно, когда вам нужен быстрый доступ к пропускной способности. Поймите, что хотя µTorrent не будет разорвать соединения самостоятельно, соединение может все еще быть сброшено клиентом на другом конце соединения.
Стоп остановит выбранные торрент-задания. Все соединения со сверстниками сбрасываются.