У меня есть две директории с файлами в них.
dir_one содержит файлы с такими именами, как:
10.recode.vcf.map
Шаблон имени файла dir_two выглядит так:
genetic_map_GRCh37_chr10.txt
Я написал R-скрипт, который что-то делает с файлами. Чтобы запустить скрипт, мне нужно выполнить следующую команду:
Интерполяция Rscript.R 10.recode.vcf.mapgenetic_map_GRCh37_chr10.txt
Теперь я хочу запустить этот скрипт 22 раза, но не могу найти способ сопоставления двух файлов в разных каталогах.
Пока что я только понял, как извлечь общее число из имени файла:
for i in ./map_files/*
do
echo ${i} ${i} | cut -d'/' -f 3 | cut -d'.' -f 1
done
Я не уверен, что делать дальше ... Кто-нибудь может посоветовать?
Критерием сопряжения является число. № 10 в примере.
—
YKY
Оба каталога содержат множество имен файлов. Внутри каталога имена файлов отличаются только числом (в примере 10, поэтому вместо 10 будет 9, 7, 22 и так далее)
—
YKY
mapа такжеgeneticв вашем скрипте запускается строка? Вы должны рассказать нам больше о содержимом каталогов (dir_one,dir_twoа такжеmap_files) и объясните критерии сопряжения, прежде чем мы сможем помочь.