Почему обнаружение небольших эффектов в больших исследованиях указывает на предвзятость публикации?


32

В нескольких методологических документах (например, Egger et al 1997a, 1997b) обсуждается систематическая ошибка публикации, выявленная метаанализом с использованием графиков воронки, таких как приведенная ниже. Воронкообразный участок бета-блокаторов при инфаркте миокарда

Далее в статье 1997b говорится, что «при наличии предвзятости публикации ожидается, что из опубликованных исследований самые большие из них сообщат о наименьших эффектах». Но почему это так? Мне кажется, что все это докажет то, что мы уже знаем: небольшие эффекты обнаруживаются только при больших размерах выборки ; ничего не говоря об исследованиях, которые остались неопубликованными.

Кроме того, в цитируемой работе утверждается, что асимметрия, которая визуально оценивается на воронкообразном графике, «указывает на то, что была выборочная не публикация небольших исследований с менее ощутимой выгодой». Но, опять же , я не понимаю , как любые особенности исследований , которые были опубликованы может возможно сказать нам что - нибудь (позволяют нам сделать выводы) о работах , которые были не опубликованы!

Справочные материалы
Egger, M., Smith, GD & Phillips, AN (1997). Метаанализ: принципы и процедуры . BMJ, 315 (7121), 1533-1537.

Эггер М., Смит Г.Д., Шнайдер М. и Миндер С. (1997). Смещение в метаанализе выявляется с помощью простого графического теста . BMJ , 315 (7109), 629-634.


Я не думаю, что у вас это правильно. Возможно, ответ на эти вопросы и ответы может помочь stats.stackexchange.com/questions/214017/…
— mdewey

7
Для небольшого исследования, которое будет опубликовано вообще, оно должно показать большой эффект независимо от того, каков истинный размер эффекта.
— Эйнар

Ответы:


23

N(.01,.1)

p<.05

Как вы можете видеть, при предвзятости публикаций существует сильная тенденция для небольших исследований переоценивать размеры эффекта, а для более крупных - сообщать о величинах эффекта, более близких к истине.

set.seed(20-02-19)

n_studies <- 1000
sample_size <- sample(2:2000, n_studies, replace=T)

studies <- plyr::aaply(sample_size, 1, function(size) {
  dat <- rnorm(size, mean = .01, sd = .1)
  c(effect_size=mean(dat), p_value=t.test(dat)$p.value)
})

studies <- cbind(studies, sample_size=log(sample_size))

include <- studies[, "p_value"] < .05

plot(studies[, "sample_size"], studies[, "effect_size"], 
     xlab = "log(sample size)", ylab="effect size",
     col=ifelse(include, "black", "grey"), pch=20)
lines(lowess(x = studies[, "sample_size"], studies[, "effect_size"]), col="grey", lwd=2)
lines(lowess(x = studies[include, "sample_size"], studies[include, "effect_size"]), col="red", lwd=2)
abline(h=.01)

Создано 2019-02-20 пакетом представлением (v0.2.1)


1
Отличный момент, действительно помогает понять это интуитивно, спасибо!
— z8080

2
+1 Это изображение стоит тысячи слов и хорошо описывает проблему. Этот тип смещения может быть даже обнаружен, когда истинный размер эффекта равен 0.
— Подрыватель

29

Во-первых, нам нужно подумать о том, что такое «предвзятость публикации» и как она повлияет на то, что в действительности превращается в литературу.

p<0.05|θ^|/SE(θ^)>1.96nSE(θ^)|θ^|

θ|θ^| θ^|θ| на самом деле значительно меньше, чем то, что мы обычно видим из меньших экспериментов, которые фактически делают это в публикацию.

|θ^| SE(θ^)p<0.05


nSE(θ)|θ|SE(θ)=SD(θ)nSE(θ)SE

19

Прочитайте это утверждение по-другому:

Если нет смещения публикации, размер эффекта должен быть независимым от размера исследования.

То есть, если вы изучаете одно явление, размер эффекта - это свойство явления, а не выборка / исследование.

Оценки величины эффекта могут (и будут) варьироваться в зависимости от исследования, но если есть систематическое уменьшение размера эффекта с увеличением размера исследования , это говорит о наличии предвзятости. Все дело в том, что эта взаимосвязь предполагает, что существуют дополнительные небольшие исследования, показывающие низкий размер эффекта, которые не были опубликованы, и если они были опубликованы и, следовательно, могли быть включены в метаанализ, общее впечатление было бы, что размер эффекта меньше чем то, что оценивается по опубликованному подмножеству исследований.

Дисперсия оценок размера эффекта в разных исследованиях будет зависеть от размера выборки, но вы должны увидеть одинаковое количество заниженных и завышенных оценок при малых размерах выборки, если не было смещения.


1
Но действительно ли правильно говорить, что «если нет предвзятости публикации, размер эффекта не должен зависеть от размера исследования»? Это верно, конечно, когда вы ссылаетесь на истинный базовый эффект, но я думаю, что они имеют в виду предполагаемый эффект. Величина эффекта , что это зависит от размера исследования (предполагая смещения) сводится к линейному зависимости в этой диаграмме рассеяния (высокая корреляция). Это то, чего я лично не видел ни на одном из воронкообразных графиков, хотя, конечно, многие из этих воронкообразных графиков действительно подразумевали, что существовал уклон.
— z8080

2
@ z8080 Вы правы, только если оценки среднего и стандартного отклонения несмещены, оценочный размер эффекта будет полностью независим от размера исследования, если нет смещения публикации. Поскольку стандартное отклонение выборки смещено, в оценках размера эффекта будет некоторое смещение, но это смещение мало по сравнению с уровнем смещения в исследованиях, на которые ссылаются Egger et al. В своем ответе я рассматриваю это как незначительное, предполагая, что размер выборки достаточно велик, чтобы оценка SD была почти беспристрастной, и поэтому считаю, что она не зависит от размера исследования.
— Брайан Краузе

2
@ z8080 Дисперсия оценок размера эффекта будет зависеть от размера выборки, но вы должны увидеть одинаковое количество заниженных и завышенных оценок при низких размерах выборки.
— Брайан Краузе

2
«Оценки величины эффекта могут (и будут) варьироваться в зависимости от исследования, но при наличии систематической взаимосвязи между величиной эффекта и размером исследования» Эта формулировка немного неясна относительно разницы между зависимостью и величиной эффекта. Распределение размера эффекта будет различным для разного размера выборки и, следовательно, не будет зависеть от размера выборки, независимо от того, есть ли смещение. Смещение является систематическим направлением зависимости.
— накопление

@ Аккумуляция Исправляет ли мое редактирование отсутствие ясности, которое вы видели?
— Брайан Краузе
Используя наш сайт, вы подтверждаете, что прочитали и поняли нашу Политику в отношении файлов cookie и Политику конфиденциальности.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.