Недостатком является то, что при сопряжении вы не можете так быстро переключать клавиатуру между собой. Между основными IDE это, вероятно, не большая проблема, но если один человек привык к Eclipse, а другой - к vim, то будет несоответствие. Пользователь Eclipse вполне может быть не в состоянии использовать vim, в то время как пользователь vim (это я;) тратит много времени, проклиная себе под нос на ужасную медлительность использования ванильного Eclipse.
Тем не менее, я бы все-таки предпочел использовать vim сам. При условии, что ваша пара довольна тем, что один из вас «ездит» в течение длительного периода времени, все в порядке.
И я знаю, что есть плагины, чтобы Eclipse работал как vi, но я говорю о сопряжении, когда я иду и сижу с кем-то, у кого Eclipse работает так, как ему нравится, поэтому они не будут устанавливать этот плагин.