Сертификат может содержать специальное расширение доступа к информации о полномочиях ( RFC-3280 ) с URL-адресом сертификата эмитента. Большинство браузеров могут использовать расширение AIA для загрузки отсутствующего промежуточного сертификата для завершения цепочки сертификатов. Но некоторые клиенты (мобильные браузеры, OpenSSL) не поддерживают это расширение, поэтому сообщают о таком сертификате как о ненадежном.
Вы можете решить проблему неполной цепочки сертификатов вручную, объединив все сертификаты от сертификата до доверенного корневого сертификата (исключительно в этом порядке), чтобы предотвратить такие проблемы. Обратите внимание, что доверенный корневой сертификат не должен быть там, так как он уже включен в хранилище корневых сертификатов системы.
Вы должны быть в состоянии получить промежуточные сертификаты от эмитента и объединить их вместе самостоятельно. Я написал сценарий для автоматизации процедуры, он зацикливается на расширении AIA для получения правильных цепочек сертификатов. https://github.com/zakjan/cert-chain-resolver